More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6264 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6740  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 307 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1566  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 307 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6264  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 307 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4933  dihydrodipicolinate synthetase  96.74 
 
 		 307 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3227  dihydrodipicolinate synthetase  96.74 
 
 		 307 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5282  dihydrodipicolinate synthetase  84.59 
 
 		 309 aa  534  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2683  dihydrodipicolinate synthetase  80.2 
 
 		 308 aa  518  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02728  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00110)  76.39 
 
 		 309 aa  465  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.753115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3377  dihydrodipicolinate synthetase  74.92 
 
 		 311 aa  465  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0601  dihydrodipicolinate synthetase  73.27 
 
 		 308 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02600  dihydrodipicolinate synthase DapA, putative  72.85 
 
 		 383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474557  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0071  dihydrodipicolinate synthase  65.9 
 
 		 315 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3161  dihydrodipicolinate synthetase  66.23 
 
 		 315 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0466092 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3437  dihydrodipicolinate synthetase  36.3 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0930984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1167  putative dihydrodipicolinate synthetase  36.88 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0631  dihydrodipicolinate synthetase  33.44 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000301226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3342  dihydrodipicolinate synthetase  38.41 
 
 		 312 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0058629  normal  0.508652 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5676  dihydrodipicolinate synthetase  37.75 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727841  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1393  dihydrodipicolinate synthetase  36.42 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  33.12 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  33.12 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  33.12 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  33.12 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  33.12 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  33.12 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  33.12 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  32.8 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1603  dihydrodipicolinate synthetase  28.62 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  31.15 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  32.17 
 
 		 320 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  31.48 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  29.65 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  29.84 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  29.62 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  31.43 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  28.84 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  28.98 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  32.38 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  30.62 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  30.59 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  28.39 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 294 aa  99  8e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  27.53 
 
 		 301 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 291 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  29.58 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  29.64 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0929  dihydrodipicolinate synthetase  26.15 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.626944 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2150  dihydrodipicolinate synthetase  29.43 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  28.3 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  29.04 
 
 		 293 aa  97.1  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  29.28 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  28.8 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  28.8 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  27.63 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  28.99 
 
 		 298 aa  96.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  29.62 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  27.51 
 
 		 321 aa  95.5  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  26.56 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  30.52 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3771  dihydrodipicolinate synthetase  28.57 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  27.8 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6384  dihydrodipicolinate synthetase  28.12 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  30.83 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  28.25 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6617  dihydrodipicolinate synthetase  28.12 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.242372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6099  dihydrodipicolinate synthetase  27.1 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  28.53 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 319 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  30.72 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  28.53 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6215  dihydrodipicolinate synthetase  28.12 
 
 		 316 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  27.92 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 		 332 aa  93.2  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  27.94 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  27.06 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  25.82 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  27.72 
 
 		 294 aa  92.4  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  25.62 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  25.41 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  27.74 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  26.11 
 
 		 292 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  29.74 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  28.71 
 
 		 292 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  28.84 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  29.26 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>