78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6069 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  279  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  279  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  98.55 
 
 
138 aa  275  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  62.32 
 
 
138 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  62.32 
 
 
138 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  59.56 
 
 
138 aa  174  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  58.82 
 
 
138 aa  173  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  59.56 
 
 
138 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  59.56 
 
 
138 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  59.56 
 
 
138 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  59.56 
 
 
138 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  58.82 
 
 
138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  58.09 
 
 
138 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  57.35 
 
 
138 aa  168  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  57.89 
 
 
135 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  55.47 
 
 
136 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  40.46 
 
 
138 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  40.16 
 
 
157 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  43.75 
 
 
161 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  40.43 
 
 
140 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  39.84 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  32.58 
 
 
166 aa  83.6  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  41.32 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  37.98 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  35 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  33.08 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  31.21 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  34.97 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  38.24 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  36.03 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  30.37 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  28.17 
 
 
144 aa  67  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  34.56 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  32.39 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  32.65 
 
 
187 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  32.87 
 
 
143 aa  62  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  30.28 
 
 
174 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  31.69 
 
 
178 aa  60.8  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  31.51 
 
 
176 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  28.28 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  29.93 
 
 
176 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  32.89 
 
 
183 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0102  hypothetical protein  31.54 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  32.39 
 
 
149 aa  57  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  31.79 
 
 
183 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  28.79 
 
 
162 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  35.24 
 
 
184 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  32 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  27.46 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  34.62 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  22.31 
 
 
158 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  28.86 
 
 
176 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  34.62 
 
 
176 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  26.76 
 
 
179 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4793  hypothetical protein  31.93 
 
 
140 aa  50.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2238  hypothetical protein  34.71 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  28.19 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  28.19 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  28.77 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  30.48 
 
 
177 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  34.58 
 
 
177 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  27.46 
 
 
179 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  29.89 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  33.65 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  25 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  32.11 
 
 
185 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0713  hypothetical protein  25.76 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2108  hypothetical protein  22.69 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.845076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0772  hypothetical protein  26.61 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000821647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3188  hypothetical protein  23.96 
 
 
162 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4972  hypothetical protein  23.96 
 
 
162 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00226838  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0797  hypothetical protein  27.93 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.437761 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4291  hypothetical protein  23.96 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.348597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1985  hypothetical protein  26.09 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2087  hypothetical protein  29.52 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0822276  hitchhiker  0.00000491684 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  32.38 
 
 
177 aa  40.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  35.56 
 
 
195 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>