More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5793 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 351 aa  683    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 351 aa  683    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  95.85 
 
 		 340 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3072  MerR family transcriptional regulator  74.41 
 
 		 341 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5066  MerR family transcriptional regulator  77.88 
 
 		 340 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4804  MerR family transcriptional regulator  56.01 
 
 		 341 aa  354  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5640  transcriptional regulator, MerR family  60.9 
 
 		 334 aa  345  7e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 166 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 166 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  44.59 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  43.42 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 166 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  35.16 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 166 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  38.14 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  30 
 
 		 130 aa  57.8  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 258 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  29.17 
 
 		 130 aa  57  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  36.79 
 
 		 270 aa  57  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  40 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.76 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  32.38 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 138 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 161 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  31.94 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  46.27 
 
 		 246 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  36.51 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  35.9 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  47.62 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  48.33 
 
 		 117 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 152 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  49.21 
 
 		 96 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  34.38 
 
 		 224 aa  54.7  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 343 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1895  transcriptional regulator, MerR family  40.71 
 
 		 260 aa  54.7  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  unclonable  1.71834e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 98 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0631  MerR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 158 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  33.05 
 
 		 144 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 252 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 139 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 254 aa  53.9  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  39.53 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 140 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 130 aa  53.5  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2070  MerR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 140 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00505229  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 138 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  31.13 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2087  MerR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 140 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2133  MerR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 140 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0098213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 146 aa  53.5  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  46.77 
 
 		 129 aa  53.1  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  37.25 
 
 		 246 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 138 aa  53.5  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  35.4 
 
 		 254 aa  53.1  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  47.62 
 
 		 150 aa  53.1  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  46.77 
 
 		 129 aa  53.1  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 260 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  38.67 
 
 		 254 aa  52.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 304 aa  52.8  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 260 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 260 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  40.66 
 
 		 254 aa  52.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 146 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 255 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 		 142 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  30.21 
 
 		 255 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 137 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>