More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5662 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  33.78 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.48 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  33.22 
 
 		 303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  31.86 
 
 		 301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.69 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  32.54 
 
 		 301 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  37.55 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  32.66 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  32.66 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  32.66 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  32.66 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  32.66 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  32.32 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  32.32 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  33.57 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.31 
 
 		 302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.58 
 
 		 283 aa  135  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.4 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  33.33 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  30.82 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  33.09 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.81 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.06 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  31.12 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  29.62 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  35.38 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.38 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  35.38 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  31.5 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.87 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  33.1 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  32.28 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  30.56 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.63 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.77 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.4 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  30.8 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.3 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  30.07 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  29.63 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  30.07 
 
 		 289 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  28.47 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.75 
 
 		 252 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  32.85 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  32.85 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  34.62 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  28.47 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  31.93 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.57 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  33.58 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  32.72 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  29.26 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  33.22 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  30.58 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  33.57 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  27.3 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  32.58 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  29.33 
 
 		 288 aa  102  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  30.55 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  29.89 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  30 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  29.08 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  28.57 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  33.1 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  31.39 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.78 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.07 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  30.29 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2437  hypothetical protein  30.29 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2573  multidrug ABC transporter permease  30.29 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  30.29 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  30.29 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1667  hypothetical protein  30.29 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  29.62 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3621  hypothetical protein  32.01 
 
 		 319 aa  98.2  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  30.29 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  30.74 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  29.82 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  26.55 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  29.45 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 		 296 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  29.31 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 		 308 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  28.03 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.36 
 
 		 304 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  26.35 
 
 		 305 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2982  DMT family permease  29.11 
 
 		 305 aa  93.2  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  30.1 
 
 		 297 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0586  hypothetical protein  29.2 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0483784  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  30.18 
 
 		 307 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 296 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>