More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5449 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  100 
 
 
499 aa  998    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  87.37 
 
 
499 aa  866    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3849  hypothetical protein  71.25 
 
 
489 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  100 
 
 
499 aa  998    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  100 
 
 
499 aa  998    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  60.13 
 
 
464 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4896  hypothetical protein  41.61 
 
 
478 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  48.33 
 
 
300 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  44.16 
 
 
309 aa  234  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  40.2 
 
 
297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  39.66 
 
 
297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  37.16 
 
 
297 aa  221  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  39.66 
 
 
297 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  39.66 
 
 
297 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  39.66 
 
 
297 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  39.06 
 
 
297 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  37.79 
 
 
301 aa  220  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  42.57 
 
 
295 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  35.5 
 
 
307 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  34.54 
 
 
307 aa  212  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  36.18 
 
 
301 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  36.96 
 
 
306 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  38.67 
 
 
301 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  39.19 
 
 
298 aa  210  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  39.33 
 
 
301 aa  210  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  38.67 
 
 
301 aa  209  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.16 
 
 
301 aa  208  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  37.84 
 
 
299 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  39.46 
 
 
296 aa  207  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  38.78 
 
 
296 aa  207  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  35.25 
 
 
301 aa  207  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  39.12 
 
 
296 aa  206  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  34.92 
 
 
301 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  35.45 
 
 
302 aa  206  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  34.58 
 
 
301 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  39.39 
 
 
296 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  34.92 
 
 
301 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  37.21 
 
 
306 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  35.67 
 
 
301 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  34.58 
 
 
301 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  34.58 
 
 
301 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  34.58 
 
 
301 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  39.47 
 
 
309 aa  203  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  39.23 
 
 
313 aa  203  7e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  37.87 
 
 
306 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2219  hypothetical protein  36.54 
 
 
293 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.209038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  34.58 
 
 
301 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  38.26 
 
 
304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2375  hypothetical protein  40.13 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.79 
 
 
302 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  37.67 
 
 
307 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  37.79 
 
 
302 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  37.79 
 
 
302 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  34.13 
 
 
294 aa  199  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  39.74 
 
 
298 aa  199  9e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  40.8 
 
 
300 aa  199  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  37.54 
 
 
313 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  33.89 
 
 
307 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  33.89 
 
 
307 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  38.56 
 
 
313 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.46 
 
 
301 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  37.63 
 
 
302 aa  196  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  39.53 
 
 
298 aa  196  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  40 
 
 
300 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  39.74 
 
 
300 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  36.52 
 
 
305 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  34.47 
 
 
301 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  36.95 
 
 
297 aa  193  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  36.49 
 
 
297 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03426  cell division inhibitor  43.85 
 
 
295 aa  192  8e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  36.49 
 
 
297 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  36.42 
 
 
304 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  36.49 
 
 
297 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  36.49 
 
 
297 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01371  putative cell division inhibitor  33.88 
 
 
308 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0269314  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.41 
 
 
321 aa  192  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0123  putative cell division inhibitor  33.55 
 
 
308 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  41.86 
 
 
297 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01381  putative cell division inhibitor  33.88 
 
 
308 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.384424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.15 
 
 
297 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  36.15 
 
 
297 aa  190  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  36.15 
 
 
297 aa  189  9e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  36.15 
 
 
297 aa  189  9e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  36.15 
 
 
297 aa  189  9e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  36.15 
 
 
297 aa  189  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5305  hypothetical protein  39.67 
 
 
305 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  36.15 
 
 
297 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  40.62 
 
 
305 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  38.59 
 
 
316 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  35.81 
 
 
297 aa  188  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  36.86 
 
 
307 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  37.05 
 
 
312 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  35.03 
 
 
310 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  36.08 
 
 
314 aa  187  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.81 
 
 
297 aa  186  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01341  putative cell division inhibitor  32.24 
 
 
310 aa  186  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.174061  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  33.97 
 
 
309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  36.27 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  40.86 
 
 
298 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  36.27 
 
 
312 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>