More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5399 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  99.58 
 
 		 236 aa  480  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  99.58 
 
 		 236 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  88.98 
 
 		 236 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  91.49 
 
 		 236 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4095  transcriptional regulator, IclR family  77.97 
 
 		 236 aa  361  6e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267726  normal  0.126686 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3982  transcriptional regulator, IclR family  77.97 
 
 		 236 aa  361  6e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  68.09 
 
 		 242 aa  310  9e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  38.22 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 248 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  36.09 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  36.09 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  37 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  39.58 
 
 		 270 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  38.03 
 
 		 246 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  35.5 
 
 		 334 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  34.82 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  33.66 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 243 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 256 aa  92.4  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  31.88 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  31.05 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  28.04 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  30.74 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1452  IclR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.378488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.63 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  26.02 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  29.25 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  30.52 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  31.96 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  28.05 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  28.26 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  27.98 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  27.82 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  27.68 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3945  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  25.78 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  28.64 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  28.27 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  24.27 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3778  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0136  transcriptional regulator, IclR family  25.2 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4051  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  25.78 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.726111 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0140  IclR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3990  hth-type tranScriptional regulator yiaj  25.78 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3881  hth-type tranScriptional regulator yiaj  25.78 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3948  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  25 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  25 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  28.31 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3865  HTH-type transcriptional regulator  25.39 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0516  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  27.85 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1130  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4994  transcriptional regulator, IclR family  27.93 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0276676  normal  0.0169874 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  27.83 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  26.87 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  28.86 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  25.1 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  28.31 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  25.89 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  27.08 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  27.4 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  24.6 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>