More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5197 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5197  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 380 aa  772    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.093521  decreased coverage  0.00215851 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3171  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 364 aa  740    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5080  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 364 aa  740    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3178  LysR family transcriptional regulator  61.61 
 
 		 354 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.11022  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5087  LysR family transcriptional regulator  62 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5189  LysR family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 315 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 334 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 334 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 334 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 334 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 334 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 335 aa  209  9e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5120  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 334 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  37.98 
 
 		 314 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 338 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  37.98 
 
 		 314 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  37.72 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  38.68 
 
 		 295 aa  196  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 342 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4869  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00123263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4337  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 313 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2040  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1801  regulatory protein LysR  33.56 
 
 		 301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0384326  normal  0.0215354 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1802  regulatory protein LysR:LysR, substrate-binding  33.56 
 
 		 301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.450792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1863  regulatory protein LysR  33.56 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.56 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.866328  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1655  regulatory protein LysR:LysR, substrate-binding  33.56 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066773 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 340 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1755  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 318 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000250234  normal  0.12184 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4656  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3707  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381625  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 305 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3814  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 334 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.412952 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  36.61 
 
 		 297 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 324 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3326  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 319 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.424785 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2402  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  35.54 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  35.19 
 
 		 318 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 305 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  34.58 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  34.67 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0800  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 303 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.440519 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 304 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 299 aa  177  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  35.05 
 
 		 304 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0455  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 301 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15417 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4520  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310402  normal  0.633071 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5132  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 302 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.052958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4062  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0198165  normal  0.373928 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 300 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 304 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 300 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 300 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1613  LysR substrate binding domain protein  32.64 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3728  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1728  LysR substrate binding domain-containing protein  32.64 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1664  LysR substrate binding domain protein  32.99 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0885  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0579  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 304 aa  170  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 316 aa  170  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>