More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5039 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  98.25 
 
 		 514 aa  1014    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  93.36 
 
 		 512 aa  968    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  67.74 
 
 		 504 aa  705    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  70.97 
 
 		 504 aa  714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  100 
 
 		 512 aa  1031    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  93.8 
 
 		 513 aa  947    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  100 
 
 		 512 aa  1031    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  71.29 
 
 		 503 aa  711    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  74.04 
 
 		 507 aa  753    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  92.98 
 
 		 513 aa  961    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  70.36 
 
 		 503 aa  705    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  89.26 
 
 		 512 aa  922    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  60.84 
 
 		 501 aa  639    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  72.23 
 
 		 508 aa  754    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  59.43 
 
 		 494 aa  618  1e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  54.84 
 
 		 500 aa  581  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  53.61 
 
 		 498 aa  545  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  57.46 
 
 		 514 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  56.69 
 
 		 514 aa  536  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  57.46 
 
 		 514 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  54.08 
 
 		 499 aa  532  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  57.09 
 
 		 516 aa  534  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  57.49 
 
 		 514 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  54.08 
 
 		 499 aa  532  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  56.89 
 
 		 511 aa  528  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  55.34 
 
 		 515 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  55.8 
 
 		 517 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  55.94 
 
 		 520 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  53.31 
 
 		 513 aa  522  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  52.92 
 
 		 524 aa  515  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  50.1 
 
 		 500 aa  497  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  51.49 
 
 		 518 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  52.52 
 
 		 499 aa  493  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  52.23 
 
 		 524 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  51.41 
 
 		 515 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  52.02 
 
 		 524 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  51.82 
 
 		 524 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.67 
 
 		 501 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  47.67 
 
 		 501 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  51.82 
 
 		 524 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  51.82 
 
 		 524 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  51.72 
 
 		 503 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  51.62 
 
 		 516 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  52.03 
 
 		 508 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  48.69 
 
 		 506 aa  485  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.21 
 
 		 527 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  51.8 
 
 		 495 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  51.42 
 
 		 524 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  50.51 
 
 		 501 aa  480  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  49 
 
 		 505 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  50.3 
 
 		 523 aa  478  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  48.5 
 
 		 513 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  49.18 
 
 		 509 aa  477  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  51.68 
 
 		 525 aa  476  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  49.19 
 
 		 513 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  49.3 
 
 		 512 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  48.16 
 
 		 494 aa  473  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  48.3 
 
 		 513 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  51.3 
 
 		 521 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  47.48 
 
 		 501 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.1 
 
 		 525 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  48.9 
 
 		 525 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  47.48 
 
 		 501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  48.1 
 
 		 501 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  48.98 
 
 		 495 aa  465  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  48.47 
 
 		 496 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  48.89 
 
 		 511 aa  467  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  48.09 
 
 		 500 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  46.73 
 
 		 501 aa  462  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  47.19 
 
 		 501 aa  464  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  48.19 
 
 		 502 aa  461  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  47.33 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  47.08 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  47.8 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  47.48 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  47.48 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  47.48 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  47.48 
 
 		 501 aa  455  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  48.28 
 
 		 497 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  46.57 
 
 		 497 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  48.57 
 
 		 500 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  47.46 
 
 		 500 aa  456  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  47.48 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  47.48 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  47.68 
 
 		 516 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  44.74 
 
 		 504 aa  456  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  47.68 
 
 		 516 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  45.94 
 
 		 499 aa  456  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  47.68 
 
 		 501 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  46.56 
 
 		 495 aa  455  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  47.68 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  47.68 
 
 		 516 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  47.68 
 
 		 516 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  47.48 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  44.27 
 
 		 506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 		 506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 		 506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  46.08 
 
 		 501 aa  455  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  47.08 
 
 		 504 aa  455  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2996  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.34 
 
 		 506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>