More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5023 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  85.77 
 
 		 1495 aa  2306    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  34.74 
 
 		 1541 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  89.17 
 
 		 1487 aa  2434    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  34.6 
 
 		 1541 aa  645    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  62.7 
 
 		 1517 aa  1678    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  34.6 
 
 		 1541 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  34.67 
 
 		 1541 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  34.41 
 
 		 1541 aa  651    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  34.25 
 
 		 1553 aa  643    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  100 
 
 		 1494 aa  3036    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1494 aa  3036    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  34.6 
 
 		 1541 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  35.36 
 
 		 1381 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  34.53 
 
 		 1527 aa  608  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  35.38 
 
 		 1189 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  32.9 
 
 		 1475 aa  500  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  32.87 
 
 		 1457 aa  493  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  31.36 
 
 		 1447 aa  490  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  32.25 
 
 		 1428 aa  486  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  32.15 
 
 		 1422 aa  486  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  31.86 
 
 		 1437 aa  479  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  32.59 
 
 		 1423 aa  476  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  33.52 
 
 		 1485 aa  449  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  31.23 
 
 		 1679 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  33 
 
 		 1259 aa  430  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  30.39 
 
 		 1530 aa  426  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  29.77 
 
 		 1699 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  32.9 
 
 		 1639 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  33.27 
 
 		 1509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  31.7 
 
 		 1673 aa  403  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  30.01 
 
 		 1600 aa  400  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  30.12 
 
 		 1505 aa  400  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  30.03 
 
 		 1616 aa  399  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  32.59 
 
 		 1488 aa  392  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  31.2 
 
 		 1197 aa  383  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  30.83 
 
 		 1495 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  30.64 
 
 		 1528 aa  376  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  30.06 
 
 		 1489 aa  373  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  31.01 
 
 		 1528 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  33.37 
 
 		 931 aa  366  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  30.18 
 
 		 1411 aa  365  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  30.86 
 
 		 1518 aa  362  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  31.2 
 
 		 1508 aa  359  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  28.44 
 
 		 1385 aa  352  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  28.37 
 
 		 1400 aa  350  9e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  27.85 
 
 		 1409 aa  349  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  30.97 
 
 		 1611 aa  349  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  28.24 
 
 		 1446 aa  346  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  28.75 
 
 		 1421 aa  327  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  29.03 
 
 		 1386 aa  325  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  29.48 
 
 		 1572 aa  321  6e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1418 aa  315  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  29.57 
 
 		 1576 aa  315  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  30.22 
 
 		 1527 aa  313  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  29.91 
 
 		 1614 aa  313  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  28.08 
 
 		 1390 aa  311  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  29.47 
 
 		 1547 aa  310  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  27.76 
 
 		 1402 aa  306  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  30.25 
 
 		 1551 aa  305  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  30.12 
 
 		 1595 aa  303  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  28.78 
 
 		 1550 aa  303  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  29.23 
 
 		 1586 aa  303  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  29.25 
 
 		 1520 aa  300  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  27.72 
 
 		 1359 aa  299  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  27.66 
 
 		 1229 aa  296  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  28.47 
 
 		 1586 aa  295  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  27.9 
 
 		 1410 aa  293  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  31.1 
 
 		 2144 aa  293  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  29.27 
 
 		 1362 aa  292  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  28.97 
 
 		 1401 aa  283  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  28.73 
 
 		 1531 aa  283  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  26.44 
 
 		 1368 aa  275  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  26.2 
 
 		 1379 aa  273  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  26.65 
 
 		 1568 aa  271  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  28.23 
 
 		 1348 aa  266  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  28.31 
 
 		 1554 aa  266  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1419 aa  265  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  28.58 
 
 		 1434 aa  257  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1565 aa  256  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1565 aa  256  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  26.95 
 
 		 1602 aa  256  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  28.73 
 
 		 1560 aa  256  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  29.61 
 
 		 1609 aa  255  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  25.83 
 
 		 1620 aa  254  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  30.01 
 
 		 867 aa  249  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1352 aa  249  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  26.34 
 
 		 1981 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  26.46 
 
 		 1626 aa  244  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  27.17 
 
 		 1573 aa  243  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  28.01 
 
 		 1579 aa  241  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  26.65 
 
 		 1429 aa  241  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  30.2 
 
 		 924 aa  240  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  28.68 
 
 		 1428 aa  239  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  30.36 
 
 		 866 aa  236  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.44 
 
 		 1600 aa  225  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  26 
 
 		 1539 aa  224  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  26.78 
 
 		 1140 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  28.72 
 
 		 1365 aa  221  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  26.63 
 
 		 1583 aa  219  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  25.38 
 
 		 1539 aa  218  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>