More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5003 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  75.05 
 
 		 484 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  89.19 
 
 		 481 aa  821    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  97.48 
 
 		 477 aa  883    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  100 
 
 		 476 aa  939    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  100 
 
 		 476 aa  939    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  75.05 
 
 		 484 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  74.62 
 
 		 492 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  74.89 
 
 		 481 aa  620  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  48.82 
 
 		 476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  49.24 
 
 		 476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  40.14 
 
 		 469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  40.68 
 
 		 467 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  34.47 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  39.85 
 
 		 461 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  41.24 
 
 		 482 aa  252  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  39.08 
 
 		 451 aa  249  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  40.98 
 
 		 486 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  40.14 
 
 		 455 aa  246  6e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  38.17 
 
 		 485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.21 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.15 
 
 		 464 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.59 
 
 		 464 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.59 
 
 		 464 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  40.78 
 
 		 445 aa  226  8e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  35.88 
 
 		 464 aa  226  9e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.59 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.59 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.59 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.59 
 
 		 464 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.59 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.59 
 
 		 464 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  37.73 
 
 		 483 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  48.88 
 
 		 415 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  35.48 
 
 		 506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  38.22 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  47.73 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  47.92 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  36.29 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  37.26 
 
 		 495 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  33.64 
 
 		 554 aa  206  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.08 
 
 		 471 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  45.69 
 
 		 407 aa  203  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  31.25 
 
 		 498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  38.55 
 
 		 466 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  36.36 
 
 		 384 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  29.49 
 
 		 471 aa  196  8.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  38.01 
 
 		 449 aa  196  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  30.32 
 
 		 492 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  30.32 
 
 		 492 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  28.48 
 
 		 453 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  28.48 
 
 		 453 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  31.1 
 
 		 456 aa  190  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.77 
 
 		 440 aa  191  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 473 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  37.13 
 
 		 447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  40.98 
 
 		 473 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  49.22 
 
 		 467 aa  183  6e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  46.18 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  41.92 
 
 		 451 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  32.16 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  44.27 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  35.59 
 
 		 471 aa  176  6e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  30.84 
 
 		 418 aa  176  9e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  38.85 
 
 		 465 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  35.38 
 
 		 428 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  31.94 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  38.55 
 
 		 386 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  39.38 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  37.09 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  36.02 
 
 		 391 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  39.42 
 
 		 403 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  31.18 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  36.33 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  33.43 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  30.5 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  30.5 
 
 		 452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  30.5 
 
 		 452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  33.93 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  32.87 
 
 		 414 aa  167  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  30.73 
 
 		 477 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  38.93 
 
 		 398 aa  166  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  31.57 
 
 		 452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  30.02 
 
 		 452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  37.55 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  33.07 
 
 		 452 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  31.28 
 
 		 452 aa  163  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  30.68 
 
 		 473 aa  163  7e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  32.91 
 
 		 462 aa  163  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  30.84 
 
 		 452 aa  162  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  39.74 
 
 		 484 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  34.45 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  33.24 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  39.92 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.09 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  42.47 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  30.22 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  44.14 
 
 		 394 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  29.66 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  39 
 
 		 490 aa  160  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  32.62 
 
 		 460 aa  160  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>