179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4940 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  100 
 
 
304 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  100 
 
 
304 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  1.8103e-05 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  99.67 
 
 
304 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  96.05 
 
 
304 aa  604  1e-172  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  95.72 
 
 
304 aa  602  1e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  93.75 
 
 
304 aa  597  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  6.32239e-07 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  93.09 
 
 
333 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  86.18 
 
 
304 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  86.18 
 
 
304 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  86.18 
 
 
304 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  86.18 
 
 
304 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  85.86 
 
 
304 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  85.86 
 
 
304 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  83.5 
 
 
346 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  81.91 
 
 
304 aa  527  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1127  glutaminase  81.58 
 
 
304 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5773  glutaminase  80.26 
 
 
304 aa  516  1e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1143  glutaminase  76.32 
 
 
304 aa  487  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.118169 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1741  L-glutaminase  52.63 
 
 
304 aa  349  3e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  56.29 
 
 
306 aa  343  3e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0006  glutaminase  56.33 
 
 
316 aa  335  4e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.110164  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002449  glutaminase  56.33 
 
 
306 aa  332  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  55.74 
 
 
309 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7656  Glutaminase  55.92 
 
 
316 aa  332  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3193  glutaminase  53.82 
 
 
304 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.256164  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4040  glutaminase  53.49 
 
 
307 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0235597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3050  glutaminase  53.82 
 
 
304 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000590255  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03588  glutaminase  56 
 
 
306 aa  329  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0822  glutaminase  53.49 
 
 
308 aa  329  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1328  glutaminase  53.82 
 
 
304 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00785417  hitchhiker  0.00333617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3036  glutaminase  53.82 
 
 
304 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103836  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0823  glutaminase  53.49 
 
 
308 aa  328  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.963027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0147  glutaminase  53.49 
 
 
308 aa  328  9e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  3.4467e-07 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  55.12 
 
 
315 aa  327  2e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  54.43 
 
 
309 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2697  glutaminase  53.16 
 
 
304 aa  324  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.718556  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1183  glutaminase  53.11 
 
 
304 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.58411e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3965  Glutaminase  56.07 
 
 
306 aa  324  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1184  glutaminase  53.11 
 
 
304 aa  324  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000737214  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1254  glutaminase  53.11 
 
 
304 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000302254  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1111  glutaminase  53.49 
 
 
304 aa  323  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.6158e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1322  glutaminase  52.46 
 
 
304 aa  323  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.152397 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2695  glutaminase  52.46 
 
 
304 aa  323  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135832  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1126  glutaminase  52.13 
 
 
304 aa  322  6e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0389369  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09673  glutaminase  52.96 
 
 
304 aa  320  2e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.200961  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3365  glutaminase  52.13 
 
 
304 aa  319  4e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43320  glutaminase  52.82 
 
 
302 aa  319  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.524936  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3635  glutaminase  52.49 
 
 
306 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1222  glutaminase  51.48 
 
 
304 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0064518  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1638  glutaminase  54.15 
 
 
308 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1630  glutaminase  54.15 
 
 
308 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.637067  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1697  glutaminase  54.15 
 
 
308 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172096  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3197  glutaminase  51.83 
 
 
302 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0628801  normal  0.211141 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01481  predicted glutaminase  53.49 
 
 
308 aa  316  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01492  hypothetical protein  53.49 
 
 
308 aa  316  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  51.79 
 
 
308 aa  316  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2122  Glutaminase  53.49 
 
 
308 aa  316  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0470209  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2134  glutaminase  53.49 
 
 
308 aa  316  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1606  glutaminase  53.49 
 
 
308 aa  316  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188036  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1682  glutaminase  53.49 
 
 
308 aa  316  4e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.670417  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1724  glutaminase  53.49 
 
 
308 aa  316  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.334681  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1648  glutaminase  53.49 
 
 
308 aa  316  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2137  glutaminase  53.49 
 
 
308 aa  316  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.200055  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1645  glutaminase  54.15 
 
 
308 aa  315  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00641427  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2487  glutaminase  52.13 
 
 
304 aa  313  2e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.702442  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4418  Glutaminase  52.96 
 
 
308 aa  313  3e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1810  glutaminase  53.49 
 
 
308 aa  311  6e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2292  glutaminase  51.16 
 
 
302 aa  311  7e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0498348  decreased coverage  3.24531e-05 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  51.83 
 
 
309 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  50.17 
 
 
306 aa  310  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3795  glutaminase  49.17 
 
 
303 aa  309  3e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0198584  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2870  glutaminase  51.15 
 
 
304 aa  306  2e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2488  glutaminase, putative  50.17 
 
 
302 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.347136  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  50.82 
 
 
309 aa  305  7e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2796  glutaminase  50.82 
 
 
318 aa  304  1e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.394459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  52.12 
 
 
311 aa  303  3e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2652  glutaminase  51.15 
 
 
309 aa  301  8e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2375  glutaminase  51.15 
 
 
309 aa  300  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188361  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  52.53 
 
 
311 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2867  glutaminase  49.67 
 
 
307 aa  299  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.705763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  51.16 
 
 
309 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2007  glutaminase  52 
 
 
308 aa  298  8e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  52.53 
 
 
311 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2331  glutaminase  51.15 
 
 
309 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  49.5 
 
 
306 aa  296  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  49.84 
 
 
309 aa  294  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  51.64 
 
 
309 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4564  glutaminase  50.5 
 
 
306 aa  292  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3373  glutaminase  51.83 
 
 
302 aa  291  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3548  L-glutaminase  53.92 
 
 
314 aa  291  8e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0139  glutaminase  52.16 
 
 
302 aa  285  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0977  Glutaminase  44.74 
 
 
304 aa  278  7e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0137  Glutaminase  50.97 
 
 
312 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01329  glutaminase  48 
 
 
306 aa  265  8e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154372  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4370  glutaminase  46.67 
 
 
297 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0794447  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  43.58 
 
 
306 aa  241  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  42.81 
 
 
334 aa  238  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  39.29 
 
 
305 aa  235  9e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  39.29 
 
 
305 aa  235  9e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  42.38 
 
 
318 aa  233  4e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>