More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4938 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  92.29 
 
 
376 aa  682  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.04612  normal  0.0125384 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
376 aa  757  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  1.79203e-05 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  92.55 
 
 
376 aa  682  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  1.67988e-07 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3430  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
376 aa  757  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5350  histidine kinase  99.73 
 
 
376 aa  757  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485302  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0753  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  96.81 
 
 
376 aa  714  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3678  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  89.1 
 
 
376 aa  662  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.227613 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1782  sensor histidine kinase  78.51 
 
 
371 aa  574  1e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0816  sensor histidine kinase  78.24 
 
 
401 aa  571  1e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2192  sensor histidine kinase  78.24 
 
 
433 aa  572  1e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0845  sensor histidine kinase  78.24 
 
 
472 aa  571  1e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1590  sensor histidine kinase  78.24 
 
 
433 aa  571  1e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0033  sensor histidine kinase  78.24 
 
 
433 aa  571  1e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.635236  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0938  sensor histidine kinase  78.24 
 
 
450 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3147  sensor histidine kinase  45.05 
 
 
478 aa  236  5e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0895878  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2591  sensor protein RstB  38.28 
 
 
434 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  37.54 
 
 
428 aa  185  1e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
523 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  36.52 
 
 
428 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.758542 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  37.33 
 
 
433 aa  179  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  37.33 
 
 
433 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  37.33 
 
 
433 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3170  sensor histidine kinase  37.02 
 
 
428 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  36.99 
 
 
433 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1570  sensor protein RstB  37.33 
 
 
433 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  0.0828626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 
428 aa  175  1e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 
563 aa  175  1e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1639  sensor protein RstB  37.33 
 
 
433 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449501  normal  0.84146 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  37.67 
 
 
433 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  37.67 
 
 
436 aa  174  3e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  37.33 
 
 
433 aa  174  3e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1825  sensor protein RstB  37.91 
 
 
434 aa  173  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  36.64 
 
 
433 aa  173  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1936  sensor protein RstB  37.91 
 
 
434 aa  173  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01578  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  36.64 
 
 
433 aa  172  6e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0585044  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1684  sensor protein RstB  36.64 
 
 
433 aa  172  6e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457824  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2021  sensor protein RstB  36.64 
 
 
433 aa  172  6e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01568  hypothetical protein  36.64 
 
 
433 aa  172  6e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0704541  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
546 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1840  sensor protein RstB  36.64 
 
 
432 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0557058 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  33.02 
 
 
561 aa  168  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  32.72 
 
 
561 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
536 aa  166  6e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1789  sensor protein RstB  34.36 
 
 
451 aa  166  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0304  histidine kinase  32.91 
 
 
347 aa  165  2e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0676  histidine kinase  34.55 
 
 
400 aa  165  2e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.887775  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0551  sensor protein RstB, putative  33.56 
 
 
429 aa  164  2e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142543  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
535 aa  164  2e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.27 
 
 
433 aa  163  5e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  33.68 
 
 
435 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
550 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
458 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
427 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.39067e-07  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
429 aa  159  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.198477  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  37.63 
 
 
442 aa  159  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
427 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.143276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  34.69 
 
 
461 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2276  sensor protein RstB  33.92 
 
 
437 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
535 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1673  sensor histidine kinase  37.31 
 
 
464 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
461 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2891  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
433 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.392127  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
535 aa  154  3e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111449  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
535 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  34.15 
 
 
536 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  37.46 
 
 
442 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  37.46 
 
 
442 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  37.46 
 
 
442 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  36.46 
 
 
442 aa  152  6e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  36.59 
 
 
442 aa  153  6e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  36.46 
 
 
442 aa  153  6e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
535 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
417 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0627622  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
469 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
456 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
456 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2581  sensor protein RstB  32.62 
 
 
437 aa  150  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  35.52 
 
 
538 aa  148  1e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3391  histidine kinase  34.15 
 
 
485 aa  147  2e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0812164  normal  0.286483 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1031  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.11 
 
 
431 aa  146  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.286161  normal  0.755502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
760 aa  145  8e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  34.13 
 
 
452 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0680  sensor histidine kinase  31.16 
 
 
433 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
430 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0937  sensor histidine kinase  33 
 
 
440 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.47175e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
422 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  6.19946e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1103  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
422 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  6.05909e-06  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
448 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0505996  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05292  histidine kinase  33.46 
 
 
428 aa  143  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3288  histidine kinase  30.45 
 
 
422 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  6.47105e-09  normal  0.19017 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
422 aa  142  1e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.07691e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1070  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
422 aa  142  1e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.72613e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3185  ATPase domain-containing protein  31.72 
 
 
422 aa  141  2e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00240847  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3595  sensor protein RstB, putative  31.4 
 
 
440 aa  140  2e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  39.56 
 
 
755 aa  141  2e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
422 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.33737e-07  normal  0.0772482 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1427  sensor protein RstB  31.11 
 
 
439 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000580  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  30.92 
 
 
431 aa  136  7e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00239122  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3205  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
409 aa  136  7e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
420 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  3.17238e-05  normal  0.345558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>