More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4936 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0756  rod shape-determining protein MreB  94.8 
 
 
346 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421254  hitchhiker  0.00154989 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3432  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
344 aa  678    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5352  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
344 aa  678    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00418366  normal  0.0848923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4936  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
344 aa  678    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000194239 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4883  rod shape-determining protein MreB  94.48 
 
 
344 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000348291 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4366  rod shape-determining protein MreB  93.6 
 
 
344 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313283 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3685  rod shape-determining protein MreB  86.18 
 
 
344 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0187994  normal  0.447669 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1780  rod shape-determining protein MreB  76.26 
 
 
384 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1586  rod shape-determining protein MreB  75.67 
 
 
354 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0819  rod shape-determining protein MreB  75.67 
 
 
354 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2194  rod shape-determining protein MreB  75.67 
 
 
382 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00417366  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0942  rod shape-determining protein MreB  75.67 
 
 
382 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258331  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0035  rod shape-determining protein MreB  75.67 
 
 
382 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0180616  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0849  rod shape-determining protein MreB  75.67 
 
 
354 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156686  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5528  rod shape-determining protein MreB  66.57 
 
 
350 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919576  normal  0.53054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1131  rod shape-determining protein MreB  68.1 
 
 
350 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5202  rod shape-determining protein MreB  64.26 
 
 
351 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866037  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 
347 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3367  rod shape-determining protein MreB  51.93 
 
 
347 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3126  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 
347 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3107  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 
347 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0059  rod shape-determining protein MreB  51.93 
 
 
347 aa  334  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259581  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0326  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 
347 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0170  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 
347 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.695664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0162  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 
347 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0525916  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0076  rod shape-determining protein MreB  51.93 
 
 
347 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0366  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 
347 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6461  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 
347 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0181  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 
347 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306812  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2785  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 
347 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0146  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 
347 aa  334  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.949868  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4398  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 
347 aa  334  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179044  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3690  rod shape-determining protein MreB  51.93 
 
 
347 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2496  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 
347 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485441  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2374  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 
347 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0052  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 
347 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618949  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3165  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 
347 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3110  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 
347 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309947  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2294  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 
347 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.691991  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3048  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 
347 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0051  rod shape-determining protein MreB  51.93 
 
 
347 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0222  rod shape-determining protein MreB  52.25 
 
 
347 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 
349 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3923  rod shape-determining protein MreB  51.95 
 
 
347 aa  330  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0320  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 
352 aa  329  4e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5235  rod shape-determining protein MreB  51.93 
 
 
347 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.979505  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 
349 aa  328  8e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2021  rod shape-determining protein MreB  51.8 
 
 
347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0698648  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 
349 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0504  rod shape-determining protein MreB  52.4 
 
 
349 aa  327  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0123409 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0083  rod shape-determining protein MreB  51.66 
 
 
347 aa  326  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.400729 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1376  rod shape-determining protein MreB  51.93 
 
 
347 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0877019  normal  0.0232358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0354  rod shape-determining protein MreB  52.73 
 
 
347 aa  325  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1738  rod shape-determining protein MreB  51.2 
 
 
347 aa  325  6e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.863773  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  51.93 
 
 
345 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  51.93 
 
 
345 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1648  rod shape-determining protein MreB  50.88 
 
 
352 aa  321  9.999999999999999e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.03031e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0515  rod shape-determining protein MreB  50.88 
 
 
352 aa  321  9.999999999999999e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0283  rod shape-determining protein MreB  51.65 
 
 
347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0116  rod shape-determining protein MreB  50.45 
 
 
347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  50.88 
 
 
345 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  51.04 
 
 
345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2728  rod shape-determining protein MreB  50.46 
 
 
347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000992624  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0233  rod shape-determining protein MreB  52.55 
 
 
347 aa  318  7e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.731526  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 
347 aa  318  7.999999999999999e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000019673  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 
345 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 
345 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 
345 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 
345 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  50.6 
 
 
345 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  50.6 
 
 
345 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  50.6 
 
 
345 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  48.67 
 
 
347 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0330  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  48.81 
 
 
348 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111648  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  48.67 
 
 
347 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0239  rod shape-determining protein MreB  52.55 
 
 
347 aa  317  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.944455 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 
347 aa  316  3e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  49.55 
 
 
347 aa  316  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 
347 aa  316  3e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  48.66 
 
 
347 aa  316  4e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 
346 aa  316  5e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 
347 aa  315  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 
347 aa  315  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1610  rod shape-determining protein MreB  52.55 
 
 
347 aa  315  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123336  normal  0.795746 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0049  rod shape-determining protein MreB  50.61 
 
 
347 aa  315  6e-85  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.483131  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 
347 aa  315  7e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 
347 aa  315  8e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  49.25 
 
 
347 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 
347 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 
347 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 
347 aa  315  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 
348 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 
347 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 
347 aa  315  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 
347 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3472  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 
349 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000392935  normal  0.627264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0479  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 
349 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000232389  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 
347 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0294  rod shape-determining protein MreB  51.65 
 
 
347 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3648  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 
349 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000380554  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>