161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4933 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  41.8 
 
 
3506 aa  736  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  48.94 
 
 
3822 aa  1026  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  47.55 
 
 
3629 aa  817  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  86.11 
 
 
2366 aa  3270  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  1.66918e-09 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  86.37 
 
 
2371 aa  3115  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  48.74 
 
 
3954 aa  1077  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  84.81 
 
 
2396 aa  3251  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  100 
 
 
2346 aa  4166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  63.82 
 
 
1508 aa  1227  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  48.96 
 
 
4238 aa  1026  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  99.45 
 
 
2365 aa  3815  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  49.35 
 
 
4238 aa  1013  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  31.21 
 
 
1881 aa  492  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  38.03 
 
 
2711 aa  460  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  36.46 
 
 
1119 aa  453  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.67 
 
 
1227 aa  443  1e-122  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.98 
 
 
1848 aa  426  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  40.25 
 
 
1971 aa  424  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  41.34 
 
 
986 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  40.63 
 
 
995 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.06 
 
 
1029 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.92 
 
 
1285 aa  382  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  34.62 
 
 
2003 aa  373  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  33.01 
 
 
1782 aa  367  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  36.98 
 
 
650 aa  348  6e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  34.39 
 
 
1519 aa  348  6e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  37.99 
 
 
1033 aa  335  8e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  37.14 
 
 
1004 aa  326  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  36.23 
 
 
2906 aa  314  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  33.11 
 
 
1530 aa  312  6e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  33.95 
 
 
990 aa  303  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.02 
 
 
919 aa  298  6e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  36.85 
 
 
991 aa  298  7e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  36.82 
 
 
995 aa  298  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  38.82 
 
 
1458 aa  294  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  36.82 
 
 
1028 aa  291  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  3.68637e-05 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  36.5 
 
 
983 aa  289  3e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  35.28 
 
 
1055 aa  288  8e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  47.03 
 
 
1459 aa  287  2e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  39.73 
 
 
1053 aa  282  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  35.84 
 
 
1001 aa  278  1e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  35.45 
 
 
1038 aa  277  2e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  51.61 
 
 
1550 aa  274  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  35.65 
 
 
1001 aa  274  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6534  outer membrane autotransporter barrel  53.12 
 
 
415 aa  273  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0435676  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.75 
 
 
972 aa  266  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  34.08 
 
 
1164 aa  265  6e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.31 
 
 
1011 aa  262  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  38.15 
 
 
1172 aa  254  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  36 
 
 
985 aa  252  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  34.2 
 
 
1333 aa  251  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  38.08 
 
 
1056 aa  250  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  32.98 
 
 
3322 aa  241  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  34.68 
 
 
994 aa  238  1e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  33.58 
 
 
1129 aa  228  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  33.58 
 
 
1131 aa  227  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  33.43 
 
 
1131 aa  225  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  33.43 
 
 
1131 aa  225  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  33.43 
 
 
1129 aa  225  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  33.43 
 
 
1131 aa  225  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  35.11 
 
 
980 aa  224  1e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  35.53 
 
 
1130 aa  219  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  33.24 
 
 
1131 aa  217  2e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  35.26 
 
 
2578 aa  213  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  34.89 
 
 
1062 aa  210  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  33.83 
 
 
1016 aa  209  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  32.61 
 
 
1152 aa  197  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  31.64 
 
 
1006 aa  196  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  30.28 
 
 
677 aa  193  3e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  30.43 
 
 
1111 aa  186  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.76 
 
 
1322 aa  181  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  6.38249e-09 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  31.77 
 
 
1011 aa  179  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.92 
 
 
1081 aa  168  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.76 
 
 
1125 aa  163  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  39.61 
 
 
2363 aa  157  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  36.65 
 
 
1882 aa  152  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  40.34 
 
 
1130 aa  152  1e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.62 
 
 
1532 aa  150  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  44.48 
 
 
1593 aa  147  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  34.5 
 
 
3391 aa  147  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  28.51 
 
 
2057 aa  143  4e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  32.98 
 
 
1741 aa  140  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  36.68 
 
 
1113 aa  140  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  32.98 
 
 
407 aa  136  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  32.72 
 
 
488 aa  135  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  34.09 
 
 
2926 aa  133  4e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  30.7 
 
 
882 aa  132  7e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  30.52 
 
 
816 aa  130  2e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  29.24 
 
 
1180 aa  129  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  34.94 
 
 
2642 aa  127  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.32 
 
 
1694 aa  124  2e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  29.32 
 
 
1300 aa  117  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  37.5 
 
 
861 aa  116  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  4.58443e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  33.99 
 
 
3089 aa  115  1e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  40.44 
 
 
950 aa  111  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  27.72 
 
 
1769 aa  105  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  28.05 
 
 
814 aa  105  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3372  autotransporter beta-domain-containing protein  27.42 
 
 
311 aa  105  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  31.71 
 
 
1012 aa  104  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  29.88 
 
 
1019 aa  103  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.150059 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>