15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4928 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3439  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  132  1e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  3.42472e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4928  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  132  1e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  1.24086e-09  normal  0.0470528 
 
 
 
NC_010515  Bcenmc03_5359  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  132  1e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  2.08864e-08  normal  0.10332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0763  hypothetical protein  87.88 
 
 
140 aa  111  4e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00564104  hitchhiker  7.63361e-05 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1984  hypothetical protein  49.02 
 
 
55 aa  66.6  1e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3036  hypothetical protein  46 
 
 
126 aa  57.4  7e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  3.73375e-08  normal  0.010036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3932  hypothetical protein  41.07 
 
 
88 aa  56.6  1e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.938886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2800  Ankyrin  46.34 
 
 
457 aa  54.7  4e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0214  hypothetical protein  38.98 
 
 
80 aa  49.7  1e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.508022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0827  putative transmembrane protein  52.94 
 
 
68 aa  48.5  3e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179582  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0130  hypothetical protein  45.45 
 
 
75 aa  48.5  3e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47868  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0898  hypothetical protein  46.81 
 
 
68 aa  48.1  4e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318072  normal  0.671417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1660  hypothetical protein  39.62 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98544  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5300  hypothetical protein  39.62 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470279  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35910  hypothetical protein  43.14 
 
 
198 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.469138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>