94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4863 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4759  carbohydrate-selective porin OprB  90.43 
 
 		 494 aa  851    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.15964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4236  carbohydrate-selective porin OprB  91.65 
 
 		 492 aa  794    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.269576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3503  carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 514 aa  1038    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4863  carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 514 aa  1038    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3354  carbohydrate porin  78.34 
 
 		 504 aa  702    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3023  carbohydrate porin  78.34 
 
 		 504 aa  702    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0489  carbohydrate porin  78.34 
 
 		 504 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5422  carbohydrate-selective porin OprB  98.58 
 
 		 493 aa  985    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585602  normal  0.389505 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2652  carbohydrate porin  78.34 
 
 		 504 aa  702    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.486905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0309  carbohydrate porin  78.34 
 
 		 504 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2070  carbohydrate porin  78.34 
 
 		 504 aa  702    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0852  carbohydrate-selective porin OprB  90.63 
 
 		 495 aa  843    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942997 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0267  carbohydrate porin  77.96 
 
 		 514 aa  704    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0296  carbohydrate porin  78.34 
 
 		 504 aa  702    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3953  carbohydrate-selective porin OprB  57.72 
 
 		 488 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268403  normal  0.112791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4831  Carbohydrate-selective porin OprB  53.89 
 
 		 507 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0156749  normal  0.100608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1832  carbohydrate porin  54.41 
 
 		 474 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.378247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4004  carbohydrate-selective porin OprB  57.43 
 
 		 483 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3558  carbohydrate-selective porin OprB  46.67 
 
 		 534 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2528  Carbohydrate-selective porin OprB  46.4 
 
 		 502 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.310329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2156  carbohydrate-selective porin OprB  45.49 
 
 		 478 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4227  carbohydrate-selective porin OprB  39.83 
 
 		 498 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796044  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4737  Carbohydrate-selective porin OprB  38.76 
 
 		 502 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0100904  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0870  carbohydrate-selective porin OprB  38.64 
 
 		 481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  hitchhiker  0.00100235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2894  Carbohydrate-selective porin OprB  39.11 
 
 		 509 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2771  carbohydrate-selective porin OprB  39.91 
 
 		 534 aa  299  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1380  Carbohydrate-selective porin OprB  38.02 
 
 		 522 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.768391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2998  Carbohydrate-selective porin OprB  39.44 
 
 		 534 aa  296  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0904  Carbohydrate-selective porin OprB  38.15 
 
 		 481 aa  294  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0673705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1384  carbohydrate-selective porin OprB  37.7 
 
 		 490 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1659  Carbohydrate-selective porin OprB  37.7 
 
 		 490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2969  carbohydrate-selective porin OprB  35.66 
 
 		 480 aa  278  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1735  carbohydrate-selective porin OprB  39.42 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0819299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1762  Carbohydrate-selective porin OprB  37.24 
 
 		 446 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1063  Carbohydrate-selective porin OprB  35.89 
 
 		 473 aa  237  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.659002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3629  carbohydrate-selective porin OprB  35.23 
 
 		 444 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419401  decreased coverage  0.00176786 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1597  carbohydrate-selective porin OprB  30.2 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0966255  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2204  carbohydrate-selective porin OprB  29.84 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3570  carbohydrate-selective porin OprB  29.82 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2351  carbohydrate-selective porin OprB  28.97 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.348926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2957  carbohydrate-selective porin OprB  29.16 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5436  carbohydrate-selective porin, OprB family  29.27 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390026  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2711  carbohydrate-selective porin OprB  27.74 
 
 		 417 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.695739  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1331  carbohydrate-selective porin OprB  28.72 
 
 		 510 aa  120  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901069  hitchhiker  0.00588319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4200  Carbohydrate-selective porin OprB  29.57 
 
 		 482 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34960  glucose-sensitive porin  26.99 
 
 		 452 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000209451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1082  carbohydrate-selective porin OprB  27.39 
 
 		 448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0774059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2950  glucose-sensitive porin  27.2 
 
 		 452 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.393124  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4360  carbohydrate-selective porin OprB  27.56 
 
 		 444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.081551  normal  0.195321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4912  Carbohydrate-selective porin OprB  29.72 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00363735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3835  Carbohydrate-selective porin OprB  29.72 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.899229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1445  porin B  27.8 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.374886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2838  carbohydrate-selective porin OprB  26.12 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2860  carbohydrate-selective porin OprB  25.59 
 
 		 454 aa  113  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00385913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3070  carbohydrate-selective porin OprB  26.12 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.681986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1943  outer membrane porin OprB precursor  26.7 
 
 		 454 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4276  carbohydrate-selective porin OprB  27.33 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.308576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23030  glucose/carbohydrate outer membrane porin OprB precursor  26.47 
 
 		 454 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0211738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1117  carbohydrate-selective porin OprB  24.35 
 
 		 453 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00415727  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1190  Carbohydrate-selective porin OprB  27.51 
 
 		 501 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1632  putative porin B precursor outer (glucose porin) transmembrane protein  29.59 
 
 		 456 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1296  porin B  23.28 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329329  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1017  carbohydrate-selective porin OprB  26.21 
 
 		 447 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.134295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4205  carbohydrate-selective porin OprB  26.09 
 
 		 447 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1057  carbohydrate-selective porin OprB  25.98 
 
 		 447 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4366  carbohydrate-selective porin OprB  24.65 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00370105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1019  porin B  25.75 
 
 		 447 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4576  carbohydrate-selective porin OprB  24.36 
 
 		 453 aa  101  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2522  carbohydrate-selective porin, OprB family  26.89 
 
 		 418 aa  97.4  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0118751  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2150  Carbohydrate-selective porin OprB  26.89 
 
 		 418 aa  97.4  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000322479  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0154  Carbohydrate-selective porin OprB  26.58 
 
 		 395 aa  83.2  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.858222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01615  regulator of pathogenicity factors  23.54 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00130056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2178  carbohydrate-selective porin OprB  27.08 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278032  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00490  regulator of pathogenicity factors  24.36 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1771  Carbohydrate-selective porin OprB  27.32 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.799068  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4102  Carbohydrate-selective porin OprB  25.42 
 
 		 522 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.792226  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2033  Carbohydrate-selective porin OprB  25.54 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1115  Carbohydrate-selective porin OprB  24.2 
 
 		 476 aa  70.1  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.967056  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1821  Carbohydrate-selective porin OprB  23.56 
 
 		 486 aa  67  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3047  carbohydrate-selective porin OprB  26 
 
 		 391 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.854363  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1898  Carbohydrate-selective porin OprB  25.84 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.541333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2250  carbohydrate-selective porin, OprB family  25.84 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1477  Carbohydrate-selective porin OprB  23.91 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2869  Carbohydrate-selective porin OprB  21.21 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.206481 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1095  Carbohydrate-selective porin OprB  25.1 
 
 		 464 aa  54.7  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0806614  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0854  Carbohydrate-selective porin OprB  23.72 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.648225 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10870  hypothetical protein  22.85 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00009778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3871  Carbohydrate-selective porin OprB  24.36 
 
 		 484 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0231495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0812  carbohydrate-selective porin OprB  28.79 
 
 		 268 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0997  hypothetical protein  23.05 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1290  Carbohydrate-selective porin OprB  22.58 
 
 		 492 aa  45.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3489  carbohydrate-selective porin OprB  22.75 
 
 		 493 aa  44.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3564  Carbohydrate-selective porin OprB  21.85 
 
 		 486 aa  44.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1247  Carbohydrate-selective porin OprB  25.93 
 
 		 512 aa  43.9  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>