More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4840 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5444  type III secretion system protein  100 
 
 		 224 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  0.0389725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3526  type III secretion system protein  100 
 
 		 224 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4840  type III secretion system protein  100 
 
 		 224 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00372455  decreased coverage  0.00110114 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3754  type III secretion system protein  98.66 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219188 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4737  type III secretion system protein  99.11 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14844  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4215  type III secretion system protein  99.11 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03406  type III secretion system protein  56.22 
 
 		 214 aa  261  6e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257955  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0860  type III secretion system protein  55.4 
 
 		 217 aa  252  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0263491  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0430  type III secretion system protein  54.76 
 
 		 216 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146015  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1908  type III secretion system protein  54.76 
 
 		 216 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2000  type III secretion system protein  54.76 
 
 		 216 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.928178  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5928  type III secretion system protein  53.08 
 
 		 216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.128981 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5644  type III secretion system protein  51.9 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5861  type III secretion system protein  52.38 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0449  type III secretion system protein  53.02 
 
 		 220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181811 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0754  type III secretion system protein  53.59 
 
 		 216 aa  231  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0818991  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2278  type III secretion system protein  53.59 
 
 		 216 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1957  type III secretion system protein  53.11 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2195  type III secretion system protein  53.11 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1628  type III secretion system protein  53.11 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0676  type III secretion system protein  53.11 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115979  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0637  type III secretion system protein  53.11 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2439  type III secretion system protein  53.05 
 
 		 216 aa  225  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01726  type III secretion system protein  50.46 
 
 		 216 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003362  yop virulence translocation protein R  51.83 
 
 		 216 aa  221  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0045  type III secretion system protein  49.08 
 
 		 217 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42620  type III secretion system protein  50.46 
 
 		 217 aa  218  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2984  type III secretion system protein  51.64 
 
 		 216 aa  218  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2278  type III secretion system protein  45 
 
 		 216 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0242447  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1974  type III secretion system protein  45.45 
 
 		 216 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3814  type III secretion system protein  46.95 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3929  type III secretion system protein  46.95 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3902  type III secretion system protein  45.95 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1530  type III secretion system protein  43.78 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1924  type III secretion system protein  43.78 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1552  type III secretion system protein  43.78 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1515  type III secretion system protein  43.78 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0538219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1754  type III secretion system protein  43.78 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000230874  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0110  type III secretion system protein  41.67 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23338  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3122  type III secretion system protein  42.72 
 
 		 211 aa  175  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000952785  hitchhiker  0.00231518 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  40.89 
 
 		 252 aa  174  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0046  type III secretion system protein  43.66 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  42 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  41.94 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2011  flagellar biosynthetic protein FliP  48.06 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  44.22 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  44.44 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5075  type III secretion system protein  41.71 
 
 		 217 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_002620  TC0851  type III secretion system protein  39.44 
 
 		 311 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  42.25 
 
 		 257 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  42.92 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0748  surface presentation of antigens protein SpaP  41.89 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1536  surface presentation of antigens protein SpaP  41.89 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324595  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0577  surface presentation of antigens protein SpaP  41.89 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2068  surface presentation of antigens protein SpaP  41.89 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2167  surface presentation of antigens protein SpaP  41.89 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513654  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2079  surface presentation of antigens protein SpaP  41.89 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  43.63 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  44.5 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0836  surface presentation of antigens protein SpaP  40.71 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108898  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3184  surface presentation of antigens protein SpaP  37.79 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  44.02 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  42.06 
 
 		 265 aa  161  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4141  surface presentation of antigens protein SpaP  37.79 
 
 		 221 aa  161  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118649 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0187  surface presentation of antigens protein SpaP  42.92 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  42.11 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  41.18 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0245  flagellar biosynthesis protein FliP  42.86 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  41.18 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  39.64 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  41.98 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  40.55 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  40.72 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  41.31 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  43.48 
 
 		 251 aa  158  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0846  surface presentation of antigens protein SpaP  37.33 
 
 		 221 aa  158  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  39.91 
 
 		 231 aa  158  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  42.11 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  39.91 
 
 		 253 aa  158  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  40.85 
 
 		 264 aa  158  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  41.63 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3387  flagellar biosynthesis protein FliP  43.96 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  39.63 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  41.63 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  38.68 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  39.23 
 
 		 289 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3018  surface presentation of antigens protein SpaP  37.33 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000294299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  43.08 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  39.17 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  39.45 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  40.48 
 
 		 244 aa  155  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  39.45 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  37.79 
 
 		 250 aa  155  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  40.93 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  37.96 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5212  type III secretion system protein  38.61 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1208  type III secretion system protein  42.52 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338753  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0786  flagellar biosynthesis protein FliP  43.75 
 
 		 317 aa  154  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000685779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  41.15 
 
 		 251 aa  154  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  40.58 
 
 		 247 aa  154  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>