More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4838 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5446  winged helix family two component response transcriptional regulator  100 
 
 		 132 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.149365  normal  0.0360801 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4838  response regulator receiver protein  100 
 
 		 132 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0133671  decreased coverage  0.00111071 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3528  response regulator receiver protein  100 
 
 		 132 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0103557  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4213  response regulator receiver protein  96.21 
 
 		 132 aa  267  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4735  winged helix family two component response transcriptional regulator  95.45 
 
 		 132 aa  266  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.511664 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0860  response regulator receiver protein  95.45 
 
 		 132 aa  265  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3756  winged helix family two component response transcriptional regulator  92.37 
 
 		 132 aa  250  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193677 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1748  response regulator protein  77.6 
 
 		 153 aa  202  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2248  hypothetical protein  82.46 
 
 		 158 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1005  transcriptional regulator  82.46 
 
 		 158 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.492004  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0919  transcriptional regulator  82.46 
 
 		 158 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 259 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  45.16 
 
 		 232 aa  90.9  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.32 
 
 		 237 aa  90.1  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.32 
 
 		 237 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  45.78 
 
 		 237 aa  88.2  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 245 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.58 
 
 		 236 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.88 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2592  two component transcriptional regulator  43.21 
 
 		 254 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  42.35 
 
 		 271 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0484  two component transcriptional regulator  43.21 
 
 		 254 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.81925 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0512  two component transcriptional regulator  43.21 
 
 		 254 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0632255  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3599  two component transcriptional regulator  43.21 
 
 		 253 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  40.86 
 
 		 268 aa  81.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  38.2 
 
 		 228 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0416  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  38.2 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2886  two component transcriptional regulator  43.21 
 
 		 253 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541925  normal  0.0968864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0442  two component transcriptional regulator  43.21 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.248748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2719  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 248 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0438  two component transcriptional regulator  43.21 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0943  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.37 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  36.96 
 
 		 224 aa  73.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.37 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.04 
 
 		 237 aa  73.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  32.63 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1076  two-component system response regulator transcription regulator protein  43.37 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  36.14 
 
 		 228 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3520  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.98 
 
 		 236 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.130253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  36.17 
 
 		 237 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6791  two component transcriptional regulator  35.48 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0454459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  31 
 
 		 242 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  31 
 
 		 242 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  30.39 
 
 		 241 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.19 
 
 		 242 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  35.48 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  31 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  35.48 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  35.48 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  35.48 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  35.48 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  37.89 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  35.48 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  35.48 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  35.48 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2474  two component transcriptional regulator, winged helix family  34 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0950849  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  31 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  32.32 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  32.32 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  32.32 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  32.32 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1173  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 266 aa  67.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.761417  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  32.32 
 
 		 296 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  32.32 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  31 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  32.32 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.71 
 
 		 239 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.81 
 
 		 245 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0833  DNA-binding response regulator  31.5 
 
 		 260 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1354  DNA-binding response regulator  31.5 
 
 		 260 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4056  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32.35 
 
 		 275 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1744  DNA-binding response regulator  31.5 
 
 		 260 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0520  DNA-binding response regulator  31.5 
 
 		 261 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1557  DNA-binding response regulator  31.5 
 
 		 260 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0635  DNA-binding response regulator  31.5 
 
 		 260 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0959742  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 230 aa  67.4  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.66 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1583  DNA-binding response regulator  32.98 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.14 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  36.71 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  33.68 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  34.74 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1748  DNA-binding response regulator  36.17 
 
 		 389 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  31 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  29.7 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1588  DNA-binding response regulator  36.17 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0515  DNA-binding response regulator  36.17 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>