More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4740 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
211 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
211 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  97.54 
 
 
203 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  94.06 
 
 
203 aa  377  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  89.6 
 
 
203 aa  363  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  72.95 
 
 
216 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  55.78 
 
 
228 aa  224  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  52.5 
 
 
231 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  53 
 
 
231 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  52.5 
 
 
231 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  52 
 
 
231 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  54.82 
 
 
234 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  51.47 
 
 
289 aa  209  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0829  isochorismatase hydrolase  56.28 
 
 
244 aa  202  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.291924  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  45.97 
 
 
218 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  46.53 
 
 
207 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 
181 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  38.71 
 
 
210 aa  121  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  33.89 
 
 
187 aa  121  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  33.89 
 
 
187 aa  121  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  39.11 
 
 
248 aa  121  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  40.86 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  40.86 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  41.08 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  39.11 
 
 
186 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  40.33 
 
 
184 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  40.21 
 
 
217 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  32.22 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  40.32 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  31.67 
 
 
187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  31.67 
 
 
187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  32.22 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  31.67 
 
 
187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
181 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  35.57 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 
181 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  39.55 
 
 
201 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  32.78 
 
 
181 aa  115  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 
181 aa  114  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  37.22 
 
 
181 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  37.29 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  37.24 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  41.3 
 
 
199 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  31.11 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  36.67 
 
 
182 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  37.99 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  37.99 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 
193 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  41.11 
 
 
210 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  32 
 
 
185 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  36.76 
 
 
198 aa  104  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 
182 aa  104  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  38.67 
 
 
182 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  33.15 
 
 
185 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 
187 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  32.97 
 
 
184 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  40.56 
 
 
182 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 
193 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  35.18 
 
 
198 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  40.56 
 
 
182 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  36.87 
 
 
342 aa  101  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  36.87 
 
 
182 aa  101  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  34.92 
 
 
200 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  32.42 
 
 
184 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  32.42 
 
 
185 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 
196 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 
184 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  32.42 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  37.04 
 
 
209 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  34.17 
 
 
198 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  32.42 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  39.44 
 
 
210 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  38.59 
 
 
199 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  34.29 
 
 
196 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 
196 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  36.81 
 
 
174 aa  99.8  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4138  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 
211 aa  99.4  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 
185 aa  99.4  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  36.11 
 
 
359 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  38.59 
 
 
199 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0476  isochorismatase hydrolase  38.98 
 
 
209 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531958  normal  0.0271328 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  31.46 
 
 
184 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  39.09 
 
 
198 aa  98.2  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  40.56 
 
 
182 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  37.95 
 
 
202 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  38.51 
 
 
197 aa  95.9  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  37.88 
 
 
199 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  35.42 
 
 
176 aa  96.3  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  37.88 
 
 
199 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 
196 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  35.42 
 
 
176 aa  96.3  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  37.88 
 
 
199 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  32.99 
 
 
196 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  35.42 
 
 
176 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  34.72 
 
 
176 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  37.29 
 
 
203 aa  95.5  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  37.78 
 
 
190 aa  95.5  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 
186 aa  95.5  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  31.35 
 
 
184 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>