44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4693 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  89.17 
 
 		 157 aa  286  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  77.78 
 
 		 159 aa  248  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  74.84 
 
 		 163 aa  243  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5328  hypothetical protein  67.1 
 
 		 157 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0131441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3555  hypothetical protein  65.38 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.159937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0979  hypothetical protein  64.05 
 
 		 157 aa  206  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1261  hypothetical protein  61.04 
 
 		 174 aa  202  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14130  hypothetical protein  65.1 
 
 		 160 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0339955  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0971  hypothetical protein  60.78 
 
 		 158 aa  193  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1079  hypothetical protein  62.18 
 
 		 163 aa  190  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1010  hypothetical protein  60.13 
 
 		 158 aa  190  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0978  hypothetical protein  59.48 
 
 		 158 aa  189  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4245  hypothetical protein  58.82 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1255  hypothetical protein  65.77 
 
 		 160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2583  hypothetical protein  42.48 
 
 		 158 aa  157  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2797  hypothetical protein  45.75 
 
 		 156 aa  154  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3730  hypothetical protein  48.12 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0482  hypothetical protein  48.45 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6429  hypothetical protein  45.33 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1448  hypothetical protein  42.5 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4477  hypothetical protein  46.5 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl176  hypothetical protein  32.28 
 
 		 150 aa  93.6  9e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  27.01 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  28.77 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  29.92 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  26.83 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  26.83 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  27.64 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  28.32 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  24.39 
 
 		 148 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  24.19 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1540  Limonene-12-epoxide hydrolase  27.46 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  24.19 
 
 		 148 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  24.39 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1138  limonene-12-epoxide hydrolase  26.09 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.866849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  24.24 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  22.76 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  22.56 
 
 		 149 aa  42  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0165  hypothetical protein  39.62 
 
 		 125 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  23.77 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  30.16 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>