More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4640 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3728  HAD family hydrolase  100 
 
 		 242 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4640  HAD family hydrolase  100 
 
 		 242 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5664  HAD family hydrolase  99.17 
 
 		 242 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.665431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  54.71 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3243  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  54.38 
 
 		 237 aa  238  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  normal  0.9958 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0698  HAD-superfamily hydrolase  55.81 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  55.87 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0336  HAD-superfamily hydrolase  55.87 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438572  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  55.87 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  55.87 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0879  HAD family hydrolase  55.4 
 
 		 232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  55.4 
 
 		 232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2616  HAD family hydrolase  56.28 
 
 		 237 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0493  HAD family hydrolase  51.75 
 
 		 230 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0405108  hitchhiker  0.00191213 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1982  HAD family hydrolase  55.81 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2592  HAD family hydrolase  55.81 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0875  HAD family hydrolase  55.4 
 
 		 232 aa  214  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2640  HAD family hydrolase  55.35 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2508  HAD family hydrolase  54.88 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.076946  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5923  HAD family hydrolase  56.28 
 
 		 228 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0705  HAD family hydrolase  55.87 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531272  normal  0.478044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2141  hypothetical protein  53.05 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00191152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  42.01 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  41.55 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  41.55 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.64 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  40.64 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  44.24 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  42.01 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  42.01 
 
 		 240 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  43.52 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  40.64 
 
 		 244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  40.64 
 
 		 244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  40.64 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  41.82 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  41.82 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  41.82 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  41.82 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  42.27 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  41.82 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  41.82 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  41.82 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  46.05 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.65 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.77 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  35.02 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  37.38 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  37.91 
 
 		 217 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02024  hydrolase  44.17 
 
 		 206 aa  125  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.247086  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  37.33 
 
 		 230 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  38.99 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  36.79 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  39.81 
 
 		 217 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.26 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.99 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  30.54 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  37.16 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.65 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  35.02 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  37.27 
 
 		 227 aa  114  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11460  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.86 
 
 		 233 aa  114  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0237278  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  32.7 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  36.11 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  36.11 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  37.67 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  32.51 
 
 		 223 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  32.51 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.79 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.56 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  35 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0330  HAD family hydrolase  36.61 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  36.32 
 
 		 225 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 223 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  37.39 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.89 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  29.49 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  37.32 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.62 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4727  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.45 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  33.78 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  34.84 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 222 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  33.64 
 
 		 214 aa  99.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  35.78 
 
 		 218 aa  99.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.28 
 
 		 229 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.422409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2077  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.77 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.38 
 
 		 231 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  35.85 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1631  HAD family hydrolase  37.22 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318646  normal  0.223643 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0642  HAD family hydrolase  30.49 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.911495  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3773  HAD family hydrolase  39.46 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  39.47 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  35.98 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3445  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.71 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0467  HAD family hydrolase  37.27 
 
 		 219 aa  95.1  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.530029  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>