More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4550 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1242  putative outer membrane porin  85.83 
 
 		 371 aa  646    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1352  outer membrane porin  85.25 
 
 		 371 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0561388  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1437  outer membrane porin  85.25 
 
 		 371 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0213  putative outer membrane porin  85.83 
 
 		 371 aa  646    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4439  porin  93.75 
 
 		 369 aa  691    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.989602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2592  outer membrane porin protein  85.25 
 
 		 371 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0486  putative outer membrane porin  85.83 
 
 		 371 aa  646    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.278408  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4097  porin  93.75 
 
 		 367 aa  692    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1296  outer membrane protein (porin)  98.1 
 
 		 368 aa  745    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1412  porin  85.83 
 
 		 371 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170387  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4550  porin  100 
 
 		 368 aa  752    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.537681 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3975  porin  94.29 
 
 		 369 aa  697    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0863036  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3818  porin  99.73 
 
 		 369 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5754  porin  100 
 
 		 368 aa  752    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1086  putative outer membrane porin  85.83 
 
 		 371 aa  646    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5307  porin Gram-negative type  77.99 
 
 		 361 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3611  porin  73.97 
 
 		 370 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0843  OmpC family outer membrane porin  48.04 
 
 		 375 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0712597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  45.58 
 
 		 354 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  47.54 
 
 		 362 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  46.67 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  45.2 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  47.27 
 
 		 362 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  47.27 
 
 		 362 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  47.27 
 
 		 362 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  47.27 
 
 		 362 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  47.27 
 
 		 362 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  47.27 
 
 		 362 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2314  porin  44.29 
 
 		 350 aa  273  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0880  outer membrane protein (porin)-like protein  46.96 
 
 		 360 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2760  putative porin signal peptide protein  43.14 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102409  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2320  outer membrane protein (porin)-like protein  46.96 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0798185  normal  0.76892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2167  OmpC family outer membrane porin  45.6 
 
 		 369 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159789  hitchhiker  0.00000436019 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5737  outer membrane protein (porin)-like  46.83 
 
 		 359 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0160198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2455  outer membrane protein (porin)-like protein  46.96 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00019464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2414  outer membrane protein (porin)-like protein  46.56 
 
 		 358 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200003  decreased coverage  0.00381795 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2410  outer membrane protein (porin)-like protein  46.28 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08631  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1798  outer membrane protein (porin)-like  46.28 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7242  outer membrane protein (porin)  40.38 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264722  normal  0.33817 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6806  OmpC family outer membrane porin  44.04 
 
 		 383 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2271  porin  41.13 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3394  OmpC family outer membrane porin  44.03 
 
 		 383 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1119  outer membrane porin, OmpC family  43.24 
 
 		 383 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.561071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6941  outer membrane protein (porin)  39.94 
 
 		 373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000310318  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2136  porin signal peptide protein  40.86 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1174  porin  38.73 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1313  OmpC family outer membrane porin  36.08 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0122268  normal  0.936999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2933  porin  38.03 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1236  outer membrane porin lipoprotein transmembrane  36.8 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3132  porin  33.14 
 
 		 376 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.011649  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  35.06 
 
 		 386 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  34.81 
 
 		 386 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  33.08 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  32.28 
 
 		 368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  35.15 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  35 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  35 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  34.39 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  34.39 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  34.39 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  31.48 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  31.48 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  34.33 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  31.84 
 
 		 355 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  31.9 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  33.42 
 
 		 354 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  32.96 
 
 		 352 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  30.33 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  31.27 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  32.57 
 
 		 379 aa  136  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  32.99 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  34.62 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.07 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3528  OmpC family outer membrane porin  33.16 
 
 		 372 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  32.41 
 
 		 363 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  30.9 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  30.9 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  31.69 
 
 		 364 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  30.98 
 
 		 379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  31.2 
 
 		 377 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  32.69 
 
 		 361 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  28.61 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  30.43 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  32.42 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  32.63 
 
 		 363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  31.15 
 
 		 367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  33.97 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  31.85 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1722  outer membrane protein (porin)  32.54 
 
 		 357 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0914033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  32.5 
 
 		 363 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  32.01 
 
 		 383 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  33.16 
 
 		 402 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  32.4 
 
 		 363 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  30.42 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  32.19 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  32.51 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  30.3 
 
 		 373 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4547  outer membrane porin signal peptide protein  29.1 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000157102  normal  0.308815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  31.02 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  32.19 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>