More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4509 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3859  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
253 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4509  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
253 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000349091  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5795  uroporphyrin-III C-methyltransferase  99.6 
 
 
253 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.685084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1341  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  91.41 
 
 
284 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605284 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  90.62 
 
 
256 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.163503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3939  uroporphyrin-III C-methyltransferase  90.62 
 
 
283 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158955  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4145  uroporphyrin-III C-methyltransferase  91.88 
 
 
255 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0746757 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1089  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.68 
 
 
274 aa  349  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.352107  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0334  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.68 
 
 
340 aa  349  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0245  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.68 
 
 
340 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1254  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.97 
 
 
271 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.206282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1669  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.97 
 
 
271 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0086  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.97 
 
 
271 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57137  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1758  uroporphyrin-III C-methyltransferase  83.97 
 
 
271 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1168  uroporphyrin-III C-methyltransferase  84.1 
 
 
291 aa  339  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0427419  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3697  uroporphyrin-III C-methyltransferase  69.58 
 
 
254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.748365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2215  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  78.11 
 
 
271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704087  hitchhiker  0.00815746 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1982  uroporphyrin-III C-methyltransferase  77.87 
 
 
271 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.663973  normal  0.9283 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.79 
 
 
277 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2883  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.54 
 
 
288 aa  240  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.51 
 
 
261 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.492452 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2332  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.82 
 
 
269 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0126754  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2843  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.66 
 
 
269 aa  238  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2847  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.08 
 
 
274 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2321  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.05 
 
 
259 aa  236  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.842595  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2368  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.59 
 
 
270 aa  230  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2292  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.47 
 
 
308 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.318843  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3168  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.17 
 
 
285 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3532  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.33 
 
 
268 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3281  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.43 
 
 
274 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2093  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.42 
 
 
247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878943  normal  0.0902648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.71 
 
 
245 aa  224  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2090  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.79 
 
 
246 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0362421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3650  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.21 
 
 
246 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000265889  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.71 
 
 
245 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2098  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.97 
 
 
253 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00176224  decreased coverage  0.00158802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1608  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.62 
 
 
246 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000713921  decreased coverage  0.000000000148067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.84 
 
 
245 aa  221  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00949185  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5019  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.19 
 
 
261 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2103  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.84 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1778  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.52 
 
 
250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293205  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2300  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.09 
 
 
253 aa  218  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00412694  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1601  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.65 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170962  hitchhiker  0.00445927 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1654  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.44 
 
 
249 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1174  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.44 
 
 
269 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496299  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
262 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162469  hitchhiker  0.0000174023 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1628  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  0.0196415 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1573  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52 
 
 
249 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1554  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52 
 
 
294 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1585  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.44 
 
 
339 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0657013 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1649  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.88 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783334  normal  0.0340554 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3154  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
247 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.345129  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4802  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.56 
 
 
249 aa  188  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284814  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  45.06 
 
 
462 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1077  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.13 
 
 
490 aa  181  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0490237  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.51 
 
 
246 aa  180  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5891  siroheme synthase  47.03 
 
 
493 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.76 
 
 
273 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.3 
 
 
464 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  44.3 
 
 
465 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  44.3 
 
 
465 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3179  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.44 
 
 
264 aa  178  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.92 
 
 
272 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.16 
 
 
259 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2356  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.98 
 
 
262 aa  175  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.463328  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.11 
 
 
273 aa  174  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2725  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.11 
 
 
273 aa  174  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000809754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.88 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.68 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.74 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.46 
 
 
464 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  42.98 
 
 
464 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.06 
 
 
278 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.92 
 
 
463 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.44 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.92 
 
 
463 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.37 
 
 
512 aa  172  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3751  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.59 
 
 
282 aa  172  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.49 
 
 
464 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.92 
 
 
463 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0347  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.19 
 
 
464 aa  172  5.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.354994 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.97 
 
 
482 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1104  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.1 
 
 
275 aa  172  6.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217718  normal  0.455501 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  42.06 
 
 
457 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.06 
 
 
457 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.64 
 
 
277 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  42.06 
 
 
457 aa  171  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  42.06 
 
 
457 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  42.06 
 
 
457 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  42.06 
 
 
457 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  42.06 
 
 
457 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  42.06 
 
 
457 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.4 
 
 
261 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  42.06 
 
 
457 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.63 
 
 
481 aa  171  9e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.03 
 
 
258 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3269  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.96 
 
 
317 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.848441  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.78 
 
 
273 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>