More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4316 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  99.68 
 
 
310 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  89.71 
 
 
311 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3184  hypothetical protein  56.52 
 
 
315 aa  258  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.546579  normal  0.703778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  47.62 
 
 
325 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43 
 
 
325 aa  202  7e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  42.41 
 
 
289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  40.69 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  42.21 
 
 
341 aa  192  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.07 
 
 
292 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.89 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  41.78 
 
 
304 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  39.03 
 
 
330 aa  160  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  38.13 
 
 
328 aa  153  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  34.19 
 
 
315 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.25 
 
 
302 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  30 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  31.65 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.96 
 
 
309 aa  112  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  34.35 
 
 
310 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  26.88 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  27.6 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  27.6 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  30.77 
 
 
312 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  27.6 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  31.03 
 
 
293 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  26.52 
 
 
303 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  26.43 
 
 
303 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  26.52 
 
 
303 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  26.52 
 
 
303 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  26.52 
 
 
303 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  26.52 
 
 
303 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  28.76 
 
 
309 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  31.42 
 
 
311 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 
291 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  27.85 
 
 
309 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  31.19 
 
 
325 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  27.52 
 
 
309 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  30.47 
 
 
301 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  28.57 
 
 
307 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  31.97 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  27.67 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  28.91 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  30.03 
 
 
309 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  28.67 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  26.57 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  30.69 
 
 
301 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.67 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.64 
 
 
310 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  29.64 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  29.79 
 
 
294 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  27.85 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  29.77 
 
 
309 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  29.14 
 
 
310 aa  95.9  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  24.82 
 
 
299 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  29.67 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 
309 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  25.82 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.93 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  28.62 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  29.33 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  29.33 
 
 
312 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  29.33 
 
 
312 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  29.33 
 
 
312 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  29.33 
 
 
312 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  29.33 
 
 
312 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  29.33 
 
 
312 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  31.16 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.09 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  28.39 
 
 
310 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.48 
 
 
301 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  29.61 
 
 
309 aa  92  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  29.62 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  27.85 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  26.17 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  33.18 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.98 
 
 
314 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.46 
 
 
314 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 
289 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  27.15 
 
 
305 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  26.71 
 
 
304 aa  89.4  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  26.56 
 
 
313 aa  89.4  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  28.99 
 
 
310 aa  89.4  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.67 
 
 
314 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  26.17 
 
 
303 aa  89  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  33.78 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25.09 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  29.21 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25.84 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25.84 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 
299 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  25.43 
 
 
303 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.18 
 
 
314 aa  87  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  29.87 
 
 
324 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  25.84 
 
 
303 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  25.09 
 
 
303 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25.08 
 
 
303 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25.84 
 
 
303 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  32.18 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  32.65 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>