More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4245 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1766  GntR family transcriptional regulator  87.3 
 
 
495 aa  862    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0178968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3272  transcriptional regulator  97.77 
 
 
493 aa  966    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.831292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4121  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
493 aa  984    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648363  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3667  GntR family transcriptional regulator  82.59 
 
 
494 aa  818    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4245  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
493 aa  984    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0459012 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1916  GntR family transcriptional regulator  64.23 
 
 
500 aa  610  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1775  GntR family transcriptional regulator  63.56 
 
 
500 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0766  GntR family transcriptional regulator  63.56 
 
 
500 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.106463  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2034  GntR family transcriptional regulator  63.56 
 
 
500 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1059  GntR family transcriptional regulator  63.56 
 
 
500 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611003  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0682  GntR family transcriptional regulator  63.36 
 
 
500 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.984752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2058  GntR family regulatory protein  63.36 
 
 
500 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.51988  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0773  GntR family transcriptional regulator  63.56 
 
 
500 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199423  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
496 aa  292  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
492 aa  283  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 
470 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
569 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
490 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  36.33 
 
 
509 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 
502 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 
502 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  36.74 
 
 
502 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0497  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 
463 aa  270  5.9999999999999995e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
490 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  36.81 
 
 
503 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.82 
 
 
523 aa  266  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 
507 aa  266  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  36.63 
 
 
502 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  37.14 
 
 
520 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  36.13 
 
 
508 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.37 
 
 
471 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  38.34 
 
 
492 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
502 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  37.34 
 
 
520 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
509 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
477 aa  264  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
509 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
494 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 
494 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 
494 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
503 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  35.85 
 
 
523 aa  263  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.91 
 
 
472 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
501 aa  262  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.9 
 
 
501 aa  262  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  38.73 
 
 
476 aa  262  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
501 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  36.97 
 
 
494 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.55 
 
 
473 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  38.09 
 
 
494 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  36.54 
 
 
509 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  34.5 
 
 
520 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
507 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  37.39 
 
 
476 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  36.6 
 
 
507 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
504 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  36.5 
 
 
509 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.38 
 
 
515 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.76 
 
 
481 aa  257  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  36.73 
 
 
498 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  35.24 
 
 
495 aa  256  9e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
505 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  37.26 
 
 
495 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  36.72 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  35.89 
 
 
478 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
473 aa  253  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  38.39 
 
 
511 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
564 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
546 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  34.42 
 
 
561 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
507 aa  253  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
564 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  36.42 
 
 
521 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.7 
 
 
507 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.58 
 
 
509 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.13 
 
 
497 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  34.89 
 
 
444 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.34 
 
 
485 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
487 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
562 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34 
 
 
497 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  36.23 
 
 
520 aa  251  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 
444 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.06 
 
 
444 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 
444 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 
444 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  36.5 
 
 
507 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
507 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.06 
 
 
444 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
507 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4072  GntR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
458 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.84 
 
 
485 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
513 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
517 aa  249  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  38.9 
 
 
511 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
506 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 
495 aa  249  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>