40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4222 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4144  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like  100 
 
 
106 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00880983  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4222  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like protein  100 
 
 
83 aa  169  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1795  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  68.75 
 
 
194 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6764  phosphate acetyltransferase  51.67 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534993  normal  0.870017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5516  Phosphate acetyltransferase  56.25 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.16983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3205  phosphotransferase KptA/Tpt1  53.45 
 
 
184 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  hitchhiker  0.000000000338046 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00660  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  54.69 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2868  phosphate acetyltransferase  46.67 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.784433 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4788  RNA 2'-phosphotransferase  50.77 
 
 
187 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0054  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  54.69 
 
 
182 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18720  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  49.18 
 
 
215 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.635673  normal  0.289098 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4639  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  47.54 
 
 
182 aa  60.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000460049  normal  0.20738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5718  phosphotransferase KptA/Tpt1  53.23 
 
 
174 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0381  phosphotransferase KptA/Tpt1  43.48 
 
 
186 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0748  phosphate acetyltransferase  45.76 
 
 
182 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.325809  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1806  phosphate acetyltransferase  50.79 
 
 
179 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.825619  normal  0.0231057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4048  phosphotransferase KptA/Tpt1  52.63 
 
 
182 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.624394  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0438  phosphotransferase KptA/Tpt1  49.06 
 
 
180 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  54.39 
 
 
184 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4875  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  54.39 
 
 
194 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04200  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  54.39 
 
 
184 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000393415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04163  hypothetical protein  54.39 
 
 
184 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000225053  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3665  Phosphate acetyltransferase  54.39 
 
 
184 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000562336  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4559  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  54.39 
 
 
184 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4774  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  52.63 
 
 
184 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1928  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  49.15 
 
 
184 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507993  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2545  RNA 2'-phosphotransferase  45.76 
 
 
195 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2137  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  47.46 
 
 
184 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0213319  normal  0.0608547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0075  phosphotransferase KptA/Tpt1  47.17 
 
 
180 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04510  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  42.11 
 
 
180 aa  55.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350174  hitchhiker  0.00000275449 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5352  phosphotransferase KptA/Tpt1  50.77 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.74919  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2734  phosphotransferase KptA/Tpt1  50.85 
 
 
180 aa  52  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5513  putative RNA 2'-phosphotransferase  47.54 
 
 
187 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0209017  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4889  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  42.25 
 
 
182 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0177  phosphotransferase KptA/Tpt1  47.06 
 
 
177 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342477  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2451  phosphotransferase KptA/Tpt1  48.57 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  hitchhiker  0.000000261836 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0145  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  37.93 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.71719  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0729  phosphotransferase KptA/Tpt1  37.5 
 
 
192 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3135  phosphotransferase KptA/Tpt1  32.2 
 
 
180 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0143  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  34.48 
 
 
186 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.264895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>