More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4217 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1801  sugar transferase  93.15 
 
 
471 aa  813    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4149  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  100 
 
 
468 aa  934    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3640  sugar transferase  85.93 
 
 
462 aa  686    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4217  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  100 
 
 
468 aa  934    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4114  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  85.71 
 
 
472 aa  711    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4388  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  80.77 
 
 
468 aa  689    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3300  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  100 
 
 
468 aa  934    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.609439  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0535  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  61.32 
 
 
461 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0046  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  61.89 
 
 
460 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0646  putative sugar transferase  61.89 
 
 
460 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0822  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  61.89 
 
 
460 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2514  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  61.89 
 
 
460 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545923  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0660  putative sugar transferase  61.89 
 
 
460 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2892  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  61.89 
 
 
460 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2193  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  61.89 
 
 
461 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1713  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  47.2 
 
 
465 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2531  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  47.76 
 
 
461 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.603157  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1057  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.47 
 
 
465 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0543  hypothetical protein  44.01 
 
 
460 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2623  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.23 
 
 
460 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0918  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  44.23 
 
 
460 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2485  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.47 
 
 
460 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399777  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  49.35 
 
 
471 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4919  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.5 
 
 
477 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  hitchhiker  0.00190784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2276  sugar transferase  44.42 
 
 
457 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.162354 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2246  undecaprenyl- phosphate galactosephosphotransferase  45.58 
 
 
465 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.357334  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1955  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.12 
 
 
465 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233038  normal  0.963876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3704  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.51 
 
 
457 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546481  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4543  sugar transferase  45.51 
 
 
478 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3820  sugar transferase  45.51 
 
 
478 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3691  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  47.6 
 
 
445 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0510  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  48.22 
 
 
475 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3723  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.64 
 
 
457 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0732572  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5546  sugar transferase  44.64 
 
 
477 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383958  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.73 
 
 
461 aa  360  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3866  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  48.5 
 
 
461 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2258  putative sugar transferase  45.75 
 
 
471 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6023  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  48.92 
 
 
471 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  0.176572 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2474  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.63 
 
 
461 aa  349  8e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203147  normal  0.0545465 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1089  putative sugar transferase  41.92 
 
 
459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00150658  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6264  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.79 
 
 
471 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2083  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  49.85 
 
 
472 aa  332  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3724  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.45 
 
 
458 aa  329  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.218244 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4240  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  49.72 
 
 
462 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.322469 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1729  putative sugar transferase  42.48 
 
 
459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00601292  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5119  sugar transferase  52.16 
 
 
468 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.226358 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2863  sugar transferase  50.28 
 
 
470 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0842  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.15 
 
 
471 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.390574  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5835  UDP-sugar lipid carrier transferase  42.86 
 
 
468 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16230  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  49.09 
 
 
459 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1693  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  46.37 
 
 
346 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000262579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.91 
 
 
464 aa  286  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2981  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  38.01 
 
 
464 aa  286  7e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  37.91 
 
 
464 aa  285  9e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  37.91 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  37.91 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  37.8 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  37.91 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  37.91 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.68 
 
 
464 aa  280  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1382  sugar transferase  43.73 
 
 
466 aa  279  7e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.254818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.77 
 
 
464 aa  277  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.250613  normal  0.0594432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2285  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.92 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149028 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2336  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.92 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0266242  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2443  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.92 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346759 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2329  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.92 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.0477885 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2228  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.92 
 
 
464 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0995309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2860  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  43.38 
 
 
468 aa  274  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01394  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumD  45.91 
 
 
484 aa  272  8.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1536  GumD protein  37.82 
 
 
484 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0458  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  41.54 
 
 
465 aa  270  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1065  polysaccharide biosythesis protein, putative  42.73 
 
 
464 aa  270  5e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0496  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.92 
 
 
467 aa  269  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1480  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.61 
 
 
484 aa  268  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0810813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3560  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.73 
 
 
468 aa  266  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0765  putative lipopolysaccharide biosynthesis related protein  41.16 
 
 
450 aa  265  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.436958  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2903  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.03 
 
 
472 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001326  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsA sugar transferase  46.64 
 
 
466 aa  263  6e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183257  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2572  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.96 
 
 
473 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0584  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.46 
 
 
468 aa  263  6.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1675  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  42.3 
 
 
465 aa  262  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2713  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.88 
 
 
473 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.821002 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0461  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.85 
 
 
466 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323165  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2715  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  49.1 
 
 
464 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1698  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.02 
 
 
460 aa  259  8e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0279884  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2319  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.43 
 
 
496 aa  259  9e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3142  sugar transferase, putative  34.46 
 
 
473 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3449  capsular polysaccharide biosynthesis protein  45.57 
 
 
469 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0239  sugar transferase  37.03 
 
 
472 aa  258  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02480  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  40.67 
 
 
484 aa  256  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0746534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1070  sugar transferase  40.92 
 
 
469 aa  254  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05207  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.38 
 
 
466 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1801  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  43.29 
 
 
460 aa  253  6e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1125  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.3 
 
 
393 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4607  putative sugar transferase family protein  36.22 
 
 
508 aa  253  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512572  normal  0.0960232 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4288  sugar transferase  44.75 
 
 
477 aa  253  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.222096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3231  sugar transferase  43.59 
 
 
469 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143756  normal  0.890863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1154  sugar transferase  38.18 
 
 
510 aa  249  9e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3829  sugar transferase  42.06 
 
 
464 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3089  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.92 
 
 
518 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>