More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4203 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0085  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  55.77 
 
 
787 aa  785    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1087  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  55.77 
 
 
787 aa  785    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
735 aa  1471    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0101  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  56.98 
 
 
760 aa  778    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1525  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  55.77 
 
 
787 aa  785    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0394  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  55.22 
 
 
787 aa  783    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4163  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 
748 aa  1496    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.214287  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2840  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  55.9 
 
 
787 aa  787    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.540822  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2689  chain length determinant family protein  55.77 
 
 
787 aa  785    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1245  putative exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  55.77 
 
 
787 aa  785    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4203  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 
748 aa  1496    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  31.01 
 
 
740 aa  298  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  29.62 
 
 
736 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.77 
 
 
736 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  28.34 
 
 
736 aa  281  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  30.08 
 
 
730 aa  280  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  29.46 
 
 
735 aa  280  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  30.74 
 
 
746 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  28.83 
 
 
744 aa  273  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  28.23 
 
 
759 aa  272  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  30.59 
 
 
746 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  30.59 
 
 
746 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  30.76 
 
 
734 aa  271  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  29.73 
 
 
746 aa  267  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  29.01 
 
 
753 aa  266  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  27.93 
 
 
746 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  29.31 
 
 
745 aa  265  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  29.77 
 
 
746 aa  261  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  28.28 
 
 
740 aa  260  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  28.43 
 
 
734 aa  260  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.23 
 
 
761 aa  260  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.01 
 
 
726 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  29.3 
 
 
726 aa  257  6e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  31.51 
 
 
754 aa  257  6e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  29.45 
 
 
746 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  29.03 
 
 
747 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  28.45 
 
 
741 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4097  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.42 
 
 
760 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139817  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  28.37 
 
 
747 aa  250  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  29.03 
 
 
749 aa  250  7e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  27.98 
 
 
748 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3622  hypothetical protein  30.78 
 
 
760 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2866  exopolysaccharide transporter  30.37 
 
 
764 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  28.77 
 
 
745 aa  246  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  28.44 
 
 
740 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  29.22 
 
 
744 aa  245  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  27.39 
 
 
755 aa  243  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  31.23 
 
 
755 aa  241  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  29.2 
 
 
747 aa  241  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  28.94 
 
 
744 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  29.55 
 
 
755 aa  238  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  30.81 
 
 
757 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  28.3 
 
 
740 aa  234  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.94 
 
 
741 aa  234  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  27.71 
 
 
745 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  27.57 
 
 
745 aa  232  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.52 
 
 
741 aa  232  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.15 
 
 
726 aa  231  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  26.7 
 
 
720 aa  231  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  26.7 
 
 
720 aa  231  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  25.89 
 
 
719 aa  231  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  26.78 
 
 
720 aa  231  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  25.89 
 
 
719 aa  230  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.48 
 
 
726 aa  230  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  26.48 
 
 
726 aa  230  8e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.48 
 
 
726 aa  230  8e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.48 
 
 
726 aa  230  8e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.48 
 
 
726 aa  230  8e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  26.63 
 
 
716 aa  230  8e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  25.27 
 
 
721 aa  230  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  26.48 
 
 
726 aa  230  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  26.64 
 
 
720 aa  230  8e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.48 
 
 
726 aa  230  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  26.53 
 
 
739 aa  229  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  27.89 
 
 
731 aa  229  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  26.64 
 
 
720 aa  229  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  27.39 
 
 
741 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  25.75 
 
 
719 aa  229  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.34 
 
 
780 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  25.75 
 
 
719 aa  229  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  27.67 
 
 
764 aa  228  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  26.5 
 
 
720 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  27.01 
 
 
741 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  25.62 
 
 
719 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  26.84 
 
 
739 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.87 
 
 
730 aa  227  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  28.03 
 
 
781 aa  227  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.31 
 
 
780 aa  226  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  26.98 
 
 
739 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  26.36 
 
 
720 aa  226  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  26.98 
 
 
739 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  28.59 
 
 
751 aa  225  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  24.97 
 
 
723 aa  225  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.93 
 
 
741 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  26.93 
 
 
741 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  25.76 
 
 
723 aa  226  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  26.93 
 
 
741 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  29.54 
 
 
780 aa  225  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  26.22 
 
 
720 aa  224  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  24.32 
 
 
724 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>