142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4122 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  100 
 
 
255 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  100 
 
 
255 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  99.61 
 
 
255 aa  506  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  97.25 
 
 
255 aa  497  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  97.25 
 
 
255 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  96.08 
 
 
255 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  94.51 
 
 
255 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  83.92 
 
 
255 aa  427  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  83.92 
 
 
255 aa  427  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  83.53 
 
 
255 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  83.53 
 
 
260 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  83.53 
 
 
255 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  83.53 
 
 
255 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  83.53 
 
 
255 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  82.75 
 
 
255 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  78.54 
 
 
251 aa  387  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  77.91 
 
 
254 aa  384  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  78.21 
 
 
254 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  75.1 
 
 
254 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  51.22 
 
 
256 aa  240  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  27.08 
 
 
241 aa  87  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
263 aa  86.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  29.63 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  25.78 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  29.64 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  31.98 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  26.12 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  24.61 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  28.87 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  30.74 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  27.42 
 
 
616 aa  67.4  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  31.91 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  24.7 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.59 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  30.04 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  29.88 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.42 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.41 
 
 
232 aa  63.9  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  28.28 
 
 
241 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  33.6 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  22.53 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  35.34 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  35.34 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.03 
 
 
230 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  24.02 
 
 
247 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  26.51 
 
 
254 aa  58.5  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  28.69 
 
 
436 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.86 
 
 
428 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  23.85 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  29.51 
 
 
237 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  30.66 
 
 
263 aa  55.8  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  30.89 
 
 
630 aa  55.5  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  26.72 
 
 
224 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  26.58 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  24.9 
 
 
256 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  42.86 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4247  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.432694 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  28.28 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  21.84 
 
 
397 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00981  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  29.08 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  44.62 
 
 
223 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  26.09 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  29.03 
 
 
619 aa  49.7  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  32.26 
 
 
595 aa  49.7  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  35.25 
 
 
226 aa  49.3  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.58 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  31.58 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1164  sugar nucleotidyltransferases-like protein  25.53 
 
 
294 aa  48.9  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  23.44 
 
 
349 aa  48.9  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  29.55 
 
 
400 aa  48.9  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  27.27 
 
 
383 aa  48.5  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.61 
 
 
400 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  25.19 
 
 
384 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  35.38 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  32.74 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  26.83 
 
 
384 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  33.62 
 
 
346 aa  47.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  31.86 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
348 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.58 
 
 
400 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  28.69 
 
 
522 aa  46.6  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  28.85 
 
 
603 aa  46.6  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  30 
 
 
224 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  24.08 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50310  sugar nucleotidyltransferase  35.42 
 
 
220 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000057924  hitchhiker  0.000309665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  25.29 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  23.36 
 
 
243 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5598  histidinol-phosphate phosphatase family protein  35.96 
 
 
649 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1196  Nucleotidyl transferase  27.67 
 
 
251 aa  45.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  37.04 
 
 
223 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  30.7 
 
 
388 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  28.52 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  31.48 
 
 
243 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  26.34 
 
 
245 aa  45.4  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  35.65 
 
 
223 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  31.9 
 
 
397 aa  45.4  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  40 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  41.54 
 
 
236 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  31.4 
 
 
326 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>