More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4042 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  98.96 
 
 
385 aa  783    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  91.69 
 
 
385 aa  711    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  100 
 
 
385 aa  791    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  100 
 
 
385 aa  791    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  72.06 
 
 
386 aa  554  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  68.15 
 
 
385 aa  518  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  68.41 
 
 
385 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  64.8 
 
 
382 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  64.8 
 
 
382 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  64.27 
 
 
382 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  63.68 
 
 
383 aa  488  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  64.53 
 
 
382 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  62.11 
 
 
378 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  46.01 
 
 
386 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  39.43 
 
 
373 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  38.72 
 
 
387 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  36.9 
 
 
377 aa  259  8e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  39.33 
 
 
402 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  39.61 
 
 
381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  38.59 
 
 
397 aa  239  9e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  38.28 
 
 
403 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  36.16 
 
 
396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  36.49 
 
 
421 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  32.85 
 
 
404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  35.84 
 
 
391 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  33.95 
 
 
385 aa  195  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  33.04 
 
 
404 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  33.33 
 
 
404 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  33.04 
 
 
422 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  33.16 
 
 
425 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  32.27 
 
 
404 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  32.1 
 
 
410 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  33.16 
 
 
406 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  32.09 
 
 
395 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  34.82 
 
 
412 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  34.12 
 
 
402 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  31.72 
 
 
397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  30.82 
 
 
405 aa  166  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  32.93 
 
 
400 aa  166  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  34.73 
 
 
397 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  34.73 
 
 
397 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  34.52 
 
 
398 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  34.73 
 
 
397 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  34.73 
 
 
397 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  35.28 
 
 
394 aa  163  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  34.43 
 
 
397 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  33.51 
 
 
412 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  31.6 
 
 
401 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  33.15 
 
 
391 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  34.15 
 
 
400 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  33.15 
 
 
391 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  33.99 
 
 
390 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  31.51 
 
 
427 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  32.26 
 
 
401 aa  159  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
389 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  32.39 
 
 
395 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  32.63 
 
 
402 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  32.14 
 
 
400 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  32.03 
 
 
413 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  33.43 
 
 
397 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  32.55 
 
 
414 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  32.55 
 
 
414 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  32.63 
 
 
402 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  29.44 
 
 
421 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 
420 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  33.33 
 
 
402 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  35.49 
 
 
399 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  32.71 
 
 
421 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  33.24 
 
 
413 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  31.8 
 
 
404 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  34.32 
 
 
427 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  30.95 
 
 
416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  29.89 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  32.83 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  32.83 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  34.52 
 
 
395 aa  146  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  30.69 
 
 
444 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  33.88 
 
 
400 aa  145  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  29.39 
 
 
426 aa  145  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  32.52 
 
 
402 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  28.37 
 
 
447 aa  144  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  32.39 
 
 
389 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  33.52 
 
 
412 aa  143  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  34.57 
 
 
395 aa  143  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.55 
 
 
414 aa  143  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  31.44 
 
 
397 aa  143  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  35.74 
 
 
395 aa  142  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  30.48 
 
 
384 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  33.24 
 
 
397 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  30.6 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  32.81 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  32.07 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  32.81 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  30.66 
 
 
398 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  32.94 
 
 
430 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  32.39 
 
 
389 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  28.85 
 
 
395 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  27.17 
 
 
377 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  29.82 
 
 
396 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.511935 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05310  conserved hypothetical protein  32.83 
 
 
454 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400667  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>