129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3790 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  100 
 
 
233 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  100 
 
 
233 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  100 
 
 
233 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  88.94 
 
 
235 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  83.61 
 
 
240 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  82.57 
 
 
238 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  80.57 
 
 
247 aa  347  7e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  61.4 
 
 
239 aa  270  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  59.23 
 
 
244 aa  268  6e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  59.23 
 
 
244 aa  268  6e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  59.23 
 
 
244 aa  268  6e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  59.23 
 
 
244 aa  268  6e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  58.72 
 
 
246 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  51.77 
 
 
233 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  58.42 
 
 
201 aa  211  8e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  58.42 
 
 
201 aa  211  8e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  47.11 
 
 
226 aa  195  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  42.36 
 
 
229 aa  166  3e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  40.09 
 
 
221 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  40.09 
 
 
215 aa  152  6e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  42.6 
 
 
229 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  39.91 
 
 
221 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  39.66 
 
 
250 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  39.29 
 
 
221 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  38.3 
 
 
225 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  40.97 
 
 
229 aa  134  1e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  40.09 
 
 
229 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  29.86 
 
 
246 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  30.38 
 
 
253 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  30.38 
 
 
253 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  33.75 
 
 
227 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  32.74 
 
 
217 aa  120  2e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  29.45 
 
 
158 aa  57  3e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  28.75 
 
 
152 aa  53.5  3e-06  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  28.57 
 
 
163 aa  53.5  3e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  28.75 
 
 
152 aa  53.5  3e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.5 
 
 
164 aa  52.4  6e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  27.66 
 
 
149 aa  51.2  1e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  23.9 
 
 
163 aa  50.4  2e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  23.49 
 
 
302 aa  50.8  2e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  7.15462e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  27.4 
 
 
140 aa  50.8  2e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  25.49 
 
 
148 aa  50.8  2e-05  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  25.49 
 
 
151 aa  50.8  2e-05  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  23.49 
 
 
302 aa  50.8  2e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  23.49 
 
 
302 aa  50.8  2e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  23.49 
 
 
302 aa  50.4  3e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  23.97 
 
 
156 aa  50.1  3e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  23.49 
 
 
302 aa  50.4  3e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  23.97 
 
 
156 aa  50.1  3e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  27.59 
 
 
165 aa  49.7  4e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46725e-13 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  23.49 
 
 
302 aa  49.7  4e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  27.59 
 
 
165 aa  49.7  4e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  22.82 
 
 
302 aa  49.3  5e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  22.82 
 
 
302 aa  49.3  5e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  26.62 
 
 
155 aa  49.3  5e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  22.82 
 
 
302 aa  49.3  5e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  26.62 
 
 
155 aa  48.9  7e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  27.06 
 
 
165 aa  48.9  7e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4863e-14 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  27.06 
 
 
165 aa  48.9  7e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  25.35 
 
 
157 aa  48.5  9e-05  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  33.33 
 
 
158 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  26.62 
 
 
139 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  28.21 
 
 
139 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  25.83 
 
 
159 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  27.21 
 
 
164 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23984e-08 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  23.02 
 
 
154 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  27.71 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  28.06 
 
 
163 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  23.02 
 
 
154 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  25.18 
 
 
158 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  33.33 
 
 
169 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  24.46 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  28.78 
 
 
157 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  25.55 
 
 
155 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  25.17 
 
 
152 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  5.34163e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  25.18 
 
 
159 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4454  CheW protein  41.54 
 
 
137 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  26.67 
 
 
164 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.45541e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  30.43 
 
 
167 aa  47  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4473  CheW protein  41.54 
 
 
137 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738081  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  28.06 
 
 
157 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  23.24 
 
 
141 aa  46.6  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  29.5 
 
 
155 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  27.59 
 
 
168 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  41.27 
 
 
137 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  26.43 
 
 
162 aa  45.4  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  24.46 
 
 
159 aa  45.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  28.57 
 
 
187 aa  45.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  30.16 
 
 
184 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  25.53 
 
 
145 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  30.07 
 
 
158 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  31.25 
 
 
164 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  26.67 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  33.59 
 
 
158 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  27.61 
 
 
152 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  25.93 
 
 
163 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  29.41 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  24.46 
 
 
167 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  26.9 
 
 
165 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  30.77 
 
 
184 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0316337 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>