43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3750 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3750  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4613  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3773  hypothetical protein  98.94 
 
 		 94 aa  190  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.040505 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3620  hypothetical protein  84.78 
 
 		 94 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2707  hypothetical protein  63.04 
 
 		 94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2581  hypothetical protein  63.04 
 
 		 94 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2660  hypothetical protein  60.87 
 
 		 94 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935328  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2049  hypothetical protein  60.87 
 
 		 94 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  60.87 
 
 		 94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2689  hypothetical protein  59.78 
 
 		 94 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6317  hypothetical protein  49.46 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1974  hypothetical protein  37.93 
 
 		 193 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342868  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  38.2 
 
 		 615 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0639  hypothetical protein  42.55 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0552  hypothetical protein  43.96 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  37.5 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03735  hypothetical protein  39.13 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6901  hypothetical protein  39.36 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4177  hypothetical protein  39.78 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.977344 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1854  hypothetical protein  39.53 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000134574  hitchhiker  0.0000000000036226 
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  38.3 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  36 
 
 		 173 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1810  PAAR repeat-containing protein  40 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316839  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2607  hypothetical protein  36.84 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3774  hypothetical protein  37.14 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  34.52 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0266  hypothetical protein  29.63 
 
 		 203 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  38.67 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  32.26 
 
 		 175 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  34.67 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  36.49 
 
 		 453 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1060  hypothetical protein  29.03 
 
 		 193 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  37.33 
 
 		 176 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  36 
 
 		 188 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0441  hypothetical protein  33.78 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3540  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.93294  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3252  PAAR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 86 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447164  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>