More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3741 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  94.62 
 
 
420 aa  783  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  100 
 
 
405 aa  749  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  92.74 
 
 
413 aa  774  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  100 
 
 
413 aa  830  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  99.52 
 
 
413 aa  824  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  81.91 
 
 
436 aa  694  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  74.26 
 
 
412 aa  599  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  67.48 
 
 
419 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  67.48 
 
 
419 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  58.09 
 
 
416 aa  459  1e-128  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  55.88 
 
 
411 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  55.69 
 
 
415 aa  433  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  52.84 
 
 
414 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  53.61 
 
 
413 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  48.57 
 
 
417 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  50.24 
 
 
425 aa  371  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  48.78 
 
 
411 aa  364  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  47.79 
 
 
411 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  49.87 
 
 
411 aa  358  7e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  49.1 
 
 
405 aa  351  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  52.09 
 
 
403 aa  350  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  50.36 
 
 
461 aa  345  9e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  43.98 
 
 
408 aa  333  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  51.23 
 
 
418 aa  332  6e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  45.57 
 
 
407 aa  319  7e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  46.12 
 
 
409 aa  316  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  42.27 
 
 
445 aa  306  3e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  43.93 
 
 
413 aa  306  4e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  44.99 
 
 
391 aa  302  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  44.23 
 
 
428 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  46.35 
 
 
425 aa  292  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  42.4 
 
 
406 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  43 
 
 
443 aa  283  5e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  37.5 
 
 
412 aa  280  4e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  45.28 
 
 
393 aa  279  8e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  37.26 
 
 
412 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  36.82 
 
 
486 aa  229  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  35.91 
 
 
433 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  36.54 
 
 
461 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  34.12 
 
 
445 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  33.73 
 
 
436 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  37.14 
 
 
490 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  38.93 
 
 
426 aa  223  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  35.17 
 
 
419 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  35.9 
 
 
434 aa  217  3e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  36.88 
 
 
478 aa  217  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  35.61 
 
 
420 aa  216  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  38.81 
 
 
447 aa  216  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  34.69 
 
 
429 aa  216  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  33.65 
 
 
440 aa  216  6e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  33.17 
 
 
456 aa  215  9e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  34.04 
 
 
445 aa  214  3e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  36.62 
 
 
482 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  35.88 
 
 
421 aa  209  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  33.33 
 
 
426 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  32.69 
 
 
451 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  32.94 
 
 
426 aa  202  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  32.77 
 
 
430 aa  198  2e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  34.09 
 
 
459 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  31.1 
 
 
413 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  35.19 
 
 
438 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  32.15 
 
 
407 aa  189  6e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  33.96 
 
 
444 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  33.18 
 
 
447 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  30.88 
 
 
447 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  34.99 
 
 
433 aa  184  2e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  33.56 
 
 
411 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  32.55 
 
 
437 aa  183  5e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  32.7 
 
 
412 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  30.68 
 
 
441 aa  182  8e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  32.68 
 
 
405 aa  179  6e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  29.67 
 
 
444 aa  179  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  33.57 
 
 
459 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  32.86 
 
 
408 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  32.06 
 
 
426 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  32.86 
 
 
408 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  32.86 
 
 
408 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.98 
 
 
426 aa  177  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  30.86 
 
 
409 aa  176  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  29.88 
 
 
431 aa  176  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  32.78 
 
 
434 aa  176  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  33.92 
 
 
432 aa  175  1e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  30.69 
 
 
428 aa  175  1e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  31.31 
 
 
444 aa  174  2e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  32.61 
 
 
422 aa  172  7e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  30.27 
 
 
431 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  33.41 
 
 
433 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  32.82 
 
 
407 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  33.25 
 
 
440 aa  171  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  32.64 
 
 
417 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  32.64 
 
 
417 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  32.64 
 
 
417 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.83 
 
 
430 aa  169  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  31.26 
 
 
424 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  32.13 
 
 
421 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  36.1 
 
 
408 aa  167  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  31.73 
 
 
423 aa  167  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  30.34 
 
 
407 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  29.97 
 
 
401 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  34.31 
 
 
455 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>