60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3532 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3532  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 		 348 aa  692    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.304569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3987  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 		 348 aa  692    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2606  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  96.26 
 
 		 348 aa  668    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.35467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1550  hypothetical protein  50.58 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00115977  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3983  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.78 
 
 		 354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.156548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2602  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.63 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3536  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.49 
 
 		 354 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0480036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7180  desulfurizing enzyme  48.52 
 
 		 344 aa  325  6e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.857064  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5654  hypothetical protein  48.67 
 
 		 346 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0147  putative desulfurizing enzyme  47.11 
 
 		 354 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.975202  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2525  hypothetical protein  49.7 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3989  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.7 
 
 		 358 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104406 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2608  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.7 
 
 		 358 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3530  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.41 
 
 		 358 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.033604  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3346  hypothetical protein  48.22 
 
 		 354 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5652  hypothetical protein  47.27 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.777199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3347  hypothetical protein  45.7 
 
 		 352 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3816  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.53 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.442978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1546  hypothetical protein  39.14 
 
 		 355 aa  230  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.062934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3341  hypothetical protein  42.73 
 
 		 353 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1565  monooxygenase, putative  40 
 
 		 352 aa  225  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7801  hypothetical protein  42.6 
 
 		 368 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1391  hypothetical protein  38.65 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000110401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1041  desulfurizing enzyme  38.38 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3886  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.56 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3874  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.55 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6342  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.12 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6519  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.35 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6753  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.35 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0691662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0267  sulfate ester transport system substrate-binding protein  24.69 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3641  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  22.03 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1573  extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 		 326 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.817202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02360  putative binding protein component of ABC transporter  24.68 
 
 		 353 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000681113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1370  ABC transporter substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.74 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.759822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7503  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, aliphatic sulphonates  27.17 
 
 		 353 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0767  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  25.08 
 
 		 322 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.250566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0145  NMT1/THI5 like domain protein  23.38 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0400  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  22.12 
 
 		 316 aa  49.7  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.882612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  22.22 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0685  hypothetical protein  22.41 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.820561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  21.01 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2186  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.61 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  0.269946 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4036  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.77 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  21.85 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  22.22 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  22.22 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4330  NMT1/THI5 like domain protein  26.77 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.688917  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0115  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.49 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2622  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  25.5 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000404129  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4880  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  23.99 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.184039  normal  0.779449 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1999  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.18 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.46 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3482  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.94 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0134  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.78 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2438  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.4 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  23.74 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2895  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26.49 
 
 		 324 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.528553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2931  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  20.38 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0777  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.34 
 
 		 322 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7236  ABC sulfate ester transporter, periplasmic ligand binding protein  31.87 
 
 		 360 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.82896 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>