More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3482 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  98.95 
 
 		 191 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  76.34 
 
 		 187 aa  290  8e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  73.16 
 
 		 196 aa  288  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  60.33 
 
 		 187 aa  234  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  50.27 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 179 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  31.4 
 
 		 176 aa  112  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 196 aa  104  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  34.1 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 216 aa  99  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 188 aa  94.7  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 191 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 188 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  32 
 
 		 186 aa  92  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 205 aa  91.3  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  31.43 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  32.73 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 193 aa  88.6  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 188 aa  87.8  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 193 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  32.68 
 
 		 189 aa  84.3  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 600 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  26.84 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  30.94 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 363 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  30.91 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
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NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
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NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  36 
 
 		 400 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
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