More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3455 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  99.34 
 
 		 152 aa  300  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  85.9 
 
 		 156 aa  256  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  83.23 
 
 		 155 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  67.11 
 
 		 152 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  62.5 
 
 		 152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  61.84 
 
 		 152 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2990  MerR family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645103  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3219  MerR family transcriptional regulator  58.78 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199693  normal  0.39103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2702  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  53.55 
 
 		 159 aa  146  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001159  transcriptional regulator  54.2 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 143 aa  141  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1699  MerR family transcriptional regulator  55.8 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00675025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 162 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0208  MerR family regulatory protein  56.74 
 
 		 154 aa  140  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7803  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  51.91 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7475  MerR family transcriptional regulator  54.96 
 
 		 162 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 138 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5680  MerR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 171 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6044  MerR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 171 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112939 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3477  MerR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  40.43 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  52.63 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  39.47 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  43 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  43 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  40.87 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  41.59 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  43.12 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  44.35 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.39 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  44.14 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  41.1 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  38.84 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  46.94 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  38.84 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  38.39 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  36.67 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  52.24 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  39.22 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  52.24 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  31.97 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  35.54 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  49.25 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2579  MerR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136218  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  47.76 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  47.76 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0693  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  38.82 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  46.48 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4498  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>