More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3273 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  100 
 
 
409 aa  791  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  85.33 
 
 
409 aa  659  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  85.09 
 
 
409 aa  639  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  99.76 
 
 
409 aa  790  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  100 
 
 
409 aa  791  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  49.87 
 
 
414 aa  336  6e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  43.01 
 
 
396 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  37.24 
 
 
409 aa  190  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  33.07 
 
 
402 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 
381 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  30.57 
 
 
403 aa  162  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  34.49 
 
 
388 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  30.37 
 
 
397 aa  149  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  29.74 
 
 
421 aa  149  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  29.26 
 
 
410 aa  137  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  29.46 
 
 
373 aa  120  4e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  30.36 
 
 
404 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  27.22 
 
 
423 aa  115  1e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  26.94 
 
 
423 aa  114  4e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 
414 aa  113  8e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  26.61 
 
 
423 aa  111  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  28.74 
 
 
405 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
414 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  29.06 
 
 
408 aa  102  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 
394 aa  94  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  32.89 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
388 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.91868e-06  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3646  major facilitator transporter  28.65 
 
 
410 aa  86.3  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
385 aa  82  2e-14  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 
415 aa  79.3  1e-13  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  34.8 
 
 
383 aa  77  5e-13  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  28.61 
 
 
410 aa  75.1  2e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  36.67 
 
 
388 aa  73.9  4e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 
400 aa  73.2  7e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  33.54 
 
 
386 aa  71.2  3e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  25 
 
 
405 aa  68.2  2e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 
411 aa  67.8  3e-10  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  28.35 
 
 
403 aa  67  5e-10  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  23.14 
 
 
384 aa  67.4  5e-10  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  26.25 
 
 
423 aa  67  6e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 
425 aa  65.5  2e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 
413 aa  65.5  2e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  25.06 
 
 
416 aa  63.5  6e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  35.86 
 
 
463 aa  61.6  2e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 
399 aa  62  2e-08  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 
420 aa  61.2  3e-08  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 
413 aa  59.7  8e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97881e-15 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 
400 aa  60.1  8e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  27.62 
 
 
490 aa  59.7  8e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  26.99 
 
 
418 aa  59.7  8e-08  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  25.45 
 
 
413 aa  59.3  1e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  27.99 
 
 
399 aa  58.2  2e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  20.71 
 
 
399 aa  58.2  3e-07  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 
396 aa  58.2  3e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  26.82 
 
 
410 aa  57  5e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 
413 aa  57.4  5e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  30.69 
 
 
450 aa  57  6e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  30.69 
 
 
450 aa  57  6e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3923  major facilitator superfamily transporter  34.48 
 
 
462 aa  56.6  7e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.603899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
439 aa  56.2  1e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  20.99 
 
 
396 aa  55.5  2e-06  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 
461 aa  55.5  2e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  23.53 
 
 
332 aa  54.7  3e-06  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  24.72 
 
 
413 aa  54.3  3e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  24.85 
 
 
407 aa  53.9  4e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.18 
 
 
473 aa  53.9  5e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  25 
 
 
474 aa  53.5  7e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  22.78 
 
 
385 aa  53.5  7e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02152  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  35.71 
 
 
407 aa  53.1  8e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  26.47 
 
 
409 aa  53.1  9e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  34.23 
 
 
536 aa  52.8  1e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  26.62 
 
 
432 aa  52.8  1e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  25.8 
 
 
450 aa  52.8  1e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  26.62 
 
 
432 aa  52.8  1e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.47189e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  27.78 
 
 
426 aa  52.8  1e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
423 aa  53.1  1e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  26.62 
 
 
432 aa  52.8  1e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  26.62 
 
 
432 aa  52.8  1e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 
405 aa  52  2e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
400 aa  52  2e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22050  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.39 
 
 
437 aa  51.2  3e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.972538 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2731  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.28 
 
 
406 aa  51.6  3e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
850 aa  51.2  3e-05  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 
422 aa  51.2  3e-05  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  30.05 
 
 
460 aa  51.2  3e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  22.39 
 
 
393 aa  50.8  4e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 
435 aa  51.2  4e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  24.92 
 
 
383 aa  50.8  4e-05  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  36.27 
 
 
449 aa  50.8  4e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
392 aa  50.4  5e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  23.04 
 
 
408 aa  50.4  5e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 
473 aa  50.8  5e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0552  major facilitator transporter  34.46 
 
 
495 aa  50.4  5e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.767309  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2816  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  24.39 
 
 
422 aa  50.4  5e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4653  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
422 aa  50.4  6e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268151  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2055  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  28.2 
 
 
401 aa  50.4  6e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.205311  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  30.66 
 
 
584 aa  50.4  6e-05  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  21.17 
 
 
403 aa  50.1  7e-05  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>