More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3216 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 235 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 235 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  57.33 
 
 		 232 aa  248  6e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  51.95 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  54.55 
 
 		 234 aa  221  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  56.22 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  56.22 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  56.22 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  56.22 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  56.22 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  55.79 
 
 		 237 aa  218  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  53.25 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  53.68 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  55.79 
 
 		 234 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  53.68 
 
 		 234 aa  211  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  49.33 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  50.67 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  49.33 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  52.81 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  48.89 
 
 		 234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  48.89 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  48.89 
 
 		 234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  54.51 
 
 		 332 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  47.77 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.88 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 		 276 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  45.33 
 
 		 227 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  44.68 
 
 		 235 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.29 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.64 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  46.43 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  46.93 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  44.74 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  44.3 
 
 		 228 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  44.3 
 
 		 228 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  38.53 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  40.34 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.93 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 		 243 aa  148  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.27 
 
 		 243 aa  148  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  40.34 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  40.81 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  44.8 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.27 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.73 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.73 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  42.41 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  36.94 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  33.78 
 
 		 265 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 		 235 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 		 254 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 		 247 aa  120  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 		 243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  36.12 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  28.51 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  34 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 		 418 aa  94  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  36.26 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  34.02 
 
 		 193 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  30.74 
 
 		 417 aa  93.2  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  30.09 
 
 		 236 aa  92.4  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 272 aa  92.4  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  30.09 
 
 		 236 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 		 300 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09378  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  92  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.141306 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  34.08 
 
 		 276 aa  92  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  31 
 
 		 236 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 314 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  30.49 
 
 		 417 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 441 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  35.18 
 
 		 272 aa  89.4  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  36.16 
 
 		 270 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 		 278 aa  89.4  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  32.74 
 
 		 441 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 		 270 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 285 aa  89  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 		 317 aa  88.6  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 		 270 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  34.25 
 
 		 283 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 273 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  35.87 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  33.52 
 
 		 275 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.44 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 238 aa  86.3  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1505  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.83 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0160485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 270 aa  86.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 272 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 441 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 		 293 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 		 442 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>