52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3201 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  86.55 
 
 		 238 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  43 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  30.87 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  27.92 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  27.8 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  27.11 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  27.8 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  27.8 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  27.8 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  27.96 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  30.77 
 
 		 286 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  28 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  31.11 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  28.99 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  30.27 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  30 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  31.85 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  29.23 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  25.64 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  28.74 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  29.71 
 
 		 288 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  28.4 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  28.16 
 
 		 287 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  28.57 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  30.46 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  27.22 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  30.71 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  31.05 
 
 		 194 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  29.27 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  28.64 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  27.68 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  25.88 
 
 		 359 aa  46.2  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  27.33 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  33.58 
 
 		 181 aa  45.4  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  30.73 
 
 		 197 aa  45.4  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  28.76 
 
 		 227 aa  45.1  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  33.58 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  32 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  36.67 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  30 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  26.7 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1283  hypothetical protein  40 
 
 		 378 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  26.26 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  27.75 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  28.77 
 
 		 190 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  25.95 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  35.96 
 
 		 236 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  42.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1284  hypothetical protein  40 
 
 		 378 aa  42  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  29.59 
 
 		 219 aa  41.6  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>