More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3174 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  100 
 
 		 188 aa  358  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  100 
 
 		 188 aa  358  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  68.82 
 
 		 178 aa  217  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  70.93 
 
 		 177 aa  211  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  57.71 
 
 		 190 aa  185  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  58.68 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  58.68 
 
 		 174 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  57.99 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  56.89 
 
 		 177 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  58.08 
 
 		 176 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  57.49 
 
 		 176 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  58.08 
 
 		 175 aa  177  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  57.74 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  57.74 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  58.68 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3664  cytochrome B561  61.8 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000237228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  57.74 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  54.34 
 
 		 179 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  51.69 
 
 		 191 aa  138  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1667  putative type-b cytochrome  54.91 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0500145 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4644  cytochrome B561  56.4 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6723  cytochrome B561  50.29 
 
 		 180 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0175  cytochrome B561  57.49 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0231  cytochrome B561  57.31 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3459  putative cytochrome B561  51.19 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  51.96 
 
 		 177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  51.96 
 
 		 177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5485  cytochrome B561  48.82 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  49.72 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  52.25 
 
 		 177 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4409  cytochrome B561  60.71 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.57191  normal  0.183403 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  40.78 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0296  cytochrome B561  54.49 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  0.703442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  41.57 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  35.88 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  36.46 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  38.07 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  36.46 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  40.34 
 
 		 197 aa  91.7  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  37.85 
 
 		 203 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  38.15 
 
 		 184 aa  91.3  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  38.6 
 
 		 181 aa  91.3  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  39.53 
 
 		 186 aa  91.3  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  40.86 
 
 		 188 aa  90.9  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  33.33 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  35.06 
 
 		 184 aa  89  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  33.89 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  33.89 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  36.42 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  35.53 
 
 		 222 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  40.12 
 
 		 193 aa  84.7  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  29.88 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  34.71 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  39.77 
 
 		 172 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  35.03 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  35.03 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  32.95 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  35.26 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  34.78 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1333  cytochrome B561  34.5 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.666388  normal  0.933151 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  37.21 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  32.78 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  33.15 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  33.15 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  32.58 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  32.76 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  35.23 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  31.36 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  36.21 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  31.11 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  31.1 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  34.25 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  26.59 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  30.43 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  31.79 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  32.95 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  36.63 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  33.52 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  36.07 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  32.18 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  33.13 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  33.13 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  33.71 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  30.99 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  33.13 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  35.8 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  36.69 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  34.27 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  33.53 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  33.52 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  32.56 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  29.45 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  29.84 
 
 		 441 aa  72  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  28.99 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  33.14 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  32.59 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  32.37 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  30.18 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  30.18 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1770  cytochrome B561  38.41 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0412177  normal  0.670754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>