40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3004 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_3004  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  330  7e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2390  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  330  7e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3023  hypothetical protein  99.3 
 
 
143 aa  287  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2913  hypothetical protein  81.69 
 
 
142 aa  205  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2998  hypothetical protein  90.08 
 
 
123 aa  194  5e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.858311  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3083  putative lipoprotein  74.34 
 
 
142 aa  177  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1652  putative lipoprotein  74.34 
 
 
142 aa  177  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3466  putative lipoprotein  74.34 
 
 
142 aa  177  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3205  hypothetical protein  73.5 
 
 
164 aa  177  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0108  hypothetical protein  74.34 
 
 
142 aa  177  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3888  putative lipoprotein  74.34 
 
 
140 aa  177  6e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3969  putative lipoprotein  74.34 
 
 
142 aa  177  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1456  lipoprotein  55.96 
 
 
126 aa  123  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00580  putative lipoprotein  50.88 
 
 
117 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.342793  normal  0.195116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0049  putative lipoprotein  50.88 
 
 
117 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5338  hypothetical protein  45.83 
 
 
145 aa  120  1e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1251  hypothetical protein  55.17 
 
 
125 aa  119  2e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3428  hypothetical protein  51.35 
 
 
125 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01775  lipoprotein  57.58 
 
 
125 aa  118  4e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00909333  normal  0.58691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2760  hypothetical protein  52.78 
 
 
125 aa  117  5e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1450  putative lipoprotein  52.29 
 
 
118 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1338  putative lipoprotein  51.38 
 
 
133 aa  114  8e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2722  putative lipoprotein  51.38 
 
 
118 aa  113  8e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1389  putative lipoprotein  50.89 
 
 
118 aa  111  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5408  hypothetical protein  45.76 
 
 
124 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4601  putative lipoprotein  45.45 
 
 
119 aa  99  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4280  putative lipoprotein  44.55 
 
 
119 aa  97.4  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4222  putative lipoprotein  44.55 
 
 
117 aa  92  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.831557  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4013  putative lipoprotein  43.56 
 
 
117 aa  90.1  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.567759  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3561  putative lipoprotein  45.92 
 
 
118 aa  88.2  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0961019  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0881  lipoprotein  40 
 
 
135 aa  83.6  1e-15  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1494  hypothetical protein  33.98 
 
 
119 aa  75.9  2e-13  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1130  integrase/recombinase  34.91 
 
 
134 aa  66.2  2e-10  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00566164  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05524  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  60.8  8e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1765  putative lipoprotein  33.66 
 
 
116 aa  60.5  9e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0225927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4119  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
118 aa  57.8  6e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4672  hypothetical protein  32.71 
 
 
120 aa  52  3e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22674  normal  0.0530626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3788  hypothetical protein  32.08 
 
 
118 aa  50.4  9e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0370713  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0421  hypothetical protein  27.78 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0422  hypothetical protein  27.78 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>