92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2800 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2800  outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 
206 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0768098  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2186  outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 
206 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2811  outer membrane lipoprotein LolB  99.03 
 
 
206 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6130  outer membrane lipoprotein LolB  95.15 
 
 
206 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000431335  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0515  outer membrane lipoprotein LolB  88.35 
 
 
206 aa  341  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00665146  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2860  outer membrane lipoprotein LolB  87.38 
 
 
206 aa  329  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718915  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2718  outer membrane lipoprotein LolB  87.56 
 
 
201 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000827751  normal  0.448755 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0756  outer membrane lipoprotein LolB  73.03 
 
 
207 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0588  outer membrane lipoprotein LolB  73.03 
 
 
204 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0129159  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0477  outer membrane lipoprotein LolB  76.97 
 
 
209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0317  outer membrane lipoprotein LolB  59.62 
 
 
210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182895  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0572  outer membrane lipoprotein LolB  76.54 
 
 
207 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00109042  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1505  outer membrane lipoprotein LolB  75.93 
 
 
219 aa  241  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0117996  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0085  outer membrane lipoprotein LolB  75.93 
 
 
211 aa  241  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3117  outer membrane lipoprotein LolB  75.93 
 
 
215 aa  241  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.632142  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2933  outer membrane lipoprotein LolB  75.93 
 
 
201 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127236  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0587  outer membrane lipoprotein LolB  62.64 
 
 
210 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178798  hitchhiker  0.00290914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4131  outer membrane lipoprotein LolB  60.34 
 
 
211 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184636  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0291  outer membrane lipoprotein LolB  44.74 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0252  outer membrane lipoprotein LolB  42.71 
 
 
207 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171162  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0279  outer membrane lipoprotein LolB  42.71 
 
 
207 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0397  outer membrane lipoprotein LolB  42.52 
 
 
209 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000178523  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0344  outer membrane lipoprotein LolB  44.97 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0391337  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0385  outer membrane lipoprotein LolB  37.31 
 
 
186 aa  95.5  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0388895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0587  outer membrane lipoprotein LolB  30.48 
 
 
247 aa  87.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3254  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.216885  normal  0.0301472 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0680  outer membrane lipoprotein LolB  32.47 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3625  outer membrane lipoprotein LolB  37.04 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0525  outer membrane lipoprotein LolB  30.43 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3728  Outer membrane lipoprotein LolB  30.43 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0281  outer membrane lipoprotein LolB  31.43 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  32.73 
 
 
495 aa  66.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4751  outer membrane lipoprotein LolB  31.34 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208461  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0512  outer membrane lipoprotein LolB  27.32 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1054  outer membrane lipoprotein LolB, putative  28.48 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.478428  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1106  outer membrane lipoprotein LolB  31.34 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  31.29 
 
 
494 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3602  outer membrane lipoprotein LolB  24.74 
 
 
192 aa  62.8  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0946  outer membrane lipoprotein LolB  30.6 
 
 
205 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.562833  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0058  outer membrane lipoprotein LolB  27.36 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.945413  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2028  outer membrane lipoprotein LolB  27.36 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2339  outer membrane lipoprotein LolB  32.37 
 
 
203 aa  58.9  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2383  outer membrane lipoprotein LolB  29.05 
 
 
218 aa  58.5  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.571518 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2763  outer membrane lipoprotein LolB, putative  29.05 
 
 
218 aa  58.5  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0758  outer membrane lipoprotein LolB  28.36 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0768  outer membrane lipoprotein LolB  28.36 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4459  outer membrane lipoprotein LolB  28.36 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0724  outer membrane lipoprotein LolB  28.36 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1295  putative lipoprotein  27.03 
 
 
170 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1988  outer membrane lipoprotein LolB  29.14 
 
 
207 aa  54.7  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.253229  hitchhiker  0.00995537 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04545  outer membrane lipoprotein LolB  26.94 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.866316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5317  outer membrane lipoprotein LolB  30.6 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61740  outer membrane lipoprotein LolB  29.85 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00215048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1526  outer membrane lipoprotein LolB  28.66 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191238  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1166  outer membrane lipoprotein LolB  25.38 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.965253  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1910  outer membrane lipoprotein LolB  29.32 
 
 
207 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.728098 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1974  outer membrane lipoprotein LolB  29.32 
 
 
207 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356364  normal  0.962813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1544  outer membrane lipoprotein LolB  29.32 
 
 
207 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0381388  normal  0.080998 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1360  outer membrane lipoprotein LolB  29.32 
 
 
207 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1916  outer membrane lipoprotein LolB  29.32 
 
 
207 aa  51.6  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00275751  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1373  outer membrane lipoprotein LolB  31.65 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.52349e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1690  outer membrane lipoprotein LolB  32.12 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000307213  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2417  outer membrane lipoprotein LolB  32.12 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1357  outer membrane lipoprotein LolB  32.12 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000990201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1314  outer membrane lipoprotein LolB  32.12 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110519  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01184  outer membrane lipoprotein LolB precursor  32.12 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01194  hypothetical protein  32.12 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.148307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2438  outer membrane lipoprotein LolB  32.12 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243213  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2181  outer membrane lipoprotein LolB  30.18 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.865932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1933  outer membrane lipoprotein LolB  31.39 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000607555  normal  0.239463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3608  putative lipoprotein  29.63 
 
 
174 aa  48.5  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41500  outer membrane lipoprotein LolB  24.78 
 
 
208 aa  48.5  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263625  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2068  outer membrane lipoprotein LolB  29.59 
 
 
207 aa  48.5  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000433771  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2462  outer membrane lipoprotein LolB  29.59 
 
 
207 aa  48.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00307032  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2568  outer membrane lipoprotein LolB  27.37 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716093  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0788  outer membrane lipoprotein LolB  25.15 
 
 
203 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0229958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1057  outer membrane lipoprotein LolB  29.52 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0342955  normal  0.469069 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0913  outer membrane lipoprotein LolB  24.54 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0456939  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0901  putative lipoprotein  26.2 
 
 
170 aa  45.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795029  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01248  outer membrane lipoprotein LolB  27.61 
 
 
212 aa  45.1  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1758  outer membrane lipoprotein LolB  26.42 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000519306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0918  outer membrane lipoprotein LolB  25.79 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.126701  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0991  outer membrane lipoprotein LolB  23.08 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.389925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2565  outer membrane lipoprotein LolB  23.81 
 
 
218 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0608  hypothetical protein  25.21 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3231  hypothetical protein  28.21 
 
 
174 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279191  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0589  hypothetical protein  25.21 
 
 
199 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2070  outer membrane lipoprotein LolB  23.53 
 
 
206 aa  42.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00533994  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0897  putative lipoprotein  30 
 
 
171 aa  42  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1854  outer membrane lipoprotein LolB  23.71 
 
 
206 aa  42  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233451  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0826  putative lipoprotein  30 
 
 
171 aa  41.6  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0343  outer membrane lipoprotein LolB  23.5 
 
 
216 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.447592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>