More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2571 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
186 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
186 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  98.92 
 
 
186 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  97.85 
 
 
199 aa  380  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  94.62 
 
 
186 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  94.62 
 
 
186 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  93.01 
 
 
186 aa  370  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  83.87 
 
 
185 aa  333  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  83.87 
 
 
185 aa  333  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  83.87 
 
 
185 aa  333  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  83.87 
 
 
293 aa  332  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  83.87 
 
 
287 aa  332  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  83.87 
 
 
287 aa  332  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  83.87 
 
 
299 aa  332  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  81.72 
 
 
277 aa  325  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  71.11 
 
 
183 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  70 
 
 
182 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  71.02 
 
 
182 aa  278  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  66.48 
 
 
180 aa  249  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  63.64 
 
 
180 aa  243  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  64.2 
 
 
181 aa  242  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  64.2 
 
 
181 aa  242  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  63.07 
 
 
182 aa  241  6e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  60.34 
 
 
184 aa  239  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  63.43 
 
 
179 aa  235  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  61.14 
 
 
178 aa  235  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  60.23 
 
 
179 aa  234  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0764  methionine sulfoxide reductase A  62.3 
 
 
191 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  61.05 
 
 
180 aa  231  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  58.99 
 
 
181 aa  231  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  60.44 
 
 
195 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  59.89 
 
 
197 aa  229  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  62.01 
 
 
186 aa  228  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  59.09 
 
 
183 aa  226  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  60.11 
 
 
186 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  59.66 
 
 
183 aa  225  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  57.71 
 
 
180 aa  225  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  56.74 
 
 
186 aa  224  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  54.49 
 
 
180 aa  224  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  55.62 
 
 
186 aa  223  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  58.1 
 
 
209 aa  222  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  59.55 
 
 
177 aa  222  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  54.24 
 
 
182 aa  221  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  57.56 
 
 
190 aa  221  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  60 
 
 
178 aa  220  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  53.37 
 
 
266 aa  217  7e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  60.12 
 
 
228 aa  216  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 
201 aa  212  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  58.05 
 
 
184 aa  213  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  56.9 
 
 
180 aa  212  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  55.75 
 
 
185 aa  211  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  53.04 
 
 
182 aa  210  7.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  56.32 
 
 
176 aa  210  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2923  peptide methionine sulfoxide reductase  59.06 
 
 
191 aa  209  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.75 
 
 
305 aa  208  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  52.22 
 
 
184 aa  208  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  57.06 
 
 
181 aa  208  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  54.55 
 
 
225 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  51.7 
 
 
208 aa  206  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  54.19 
 
 
178 aa  205  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  56.18 
 
 
177 aa  205  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  52.75 
 
 
182 aa  205  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52 
 
 
301 aa  204  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  54.39 
 
 
175 aa  204  7e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1032  peptide methionine sulfoxide reductase  55.37 
 
 
189 aa  204  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  52.78 
 
 
178 aa  203  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  51.41 
 
 
179 aa  201  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  52.3 
 
 
186 aa  201  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.02 
 
 
309 aa  200  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  56.57 
 
 
177 aa  200  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  55.37 
 
 
179 aa  198  3e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  50.81 
 
 
182 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  52.87 
 
 
179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  54.07 
 
 
176 aa  197  6e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  48.86 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  50.86 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.66 
 
 
301 aa  195  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.87 
 
 
301 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2794  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
177 aa  194  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.578803  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  49.12 
 
 
177 aa  194  7e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  54.19 
 
 
178 aa  193  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.48 
 
 
301 aa  191  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.48 
 
 
301 aa  191  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.48 
 
 
301 aa  191  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  51.69 
 
 
180 aa  190  8e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.28 
 
 
301 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  53.53 
 
 
184 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 
175 aa  186  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  51.41 
 
 
262 aa  186  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.86 
 
 
305 aa  186  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1950  peptide methionine sulfoxide reductase  50.85 
 
 
173 aa  184  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0240  peptide methionine sulfoxide reductase  54.44 
 
 
177 aa  184  6e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1027  peptide methionine sulfoxide reductase  56.13 
 
 
164 aa  184  7e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.143691  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  49.43 
 
 
198 aa  184  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2243  peptide methionine sulfoxide reductase  50.85 
 
 
173 aa  184  7e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  49.43 
 
 
211 aa  184  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.7 
 
 
301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.28 
 
 
301 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.28 
 
 
301 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.57 
 
 
300 aa  182  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>