133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2366 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  94.47 
 
 
955 aa  1779  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  100 
 
 
958 aa  1960  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  100 
 
 
958 aa  1960  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  90.92 
 
 
955 aa  1722  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  96.43 
 
 
950 aa  1809  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  94.65 
 
 
950 aa  1768  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  97.48 
 
 
953 aa  1810  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  97.59 
 
 
953 aa  1820  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  33.33 
 
 
895 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  6.96733e-12 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  34.51 
 
 
890 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  37.44 
 
 
591 aa  412  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  38.63 
 
 
631 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  34.38 
 
 
890 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  35.75 
 
 
582 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  35.36 
 
 
689 aa  345  3e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  33.86 
 
 
911 aa  338  2e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  33.7 
 
 
845 aa  303  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  35.79 
 
 
676 aa  302  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  34.36 
 
 
633 aa  300  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  31.72 
 
 
979 aa  299  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  33.69 
 
 
658 aa  281  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  34.94 
 
 
627 aa  272  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  34.78 
 
 
930 aa  268  3e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  32.87 
 
 
515 aa  264  6e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  32.75 
 
 
580 aa  258  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  32.7 
 
 
841 aa  255  2e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  32.3 
 
 
556 aa  240  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  28.39 
 
 
929 aa  231  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  33.76 
 
 
574 aa  230  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  28.65 
 
 
878 aa  225  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  34.11 
 
 
553 aa  219  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  34.27 
 
 
1051 aa  216  1e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  45.22 
 
 
797 aa  216  2e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  44.44 
 
 
280 aa  212  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  26.26 
 
 
899 aa  210  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  38.87 
 
 
295 aa  208  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  28.89 
 
 
711 aa  181  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0173  Primase 2  38.44 
 
 
637 aa  180  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.214274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  47.06 
 
 
848 aa  175  4e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2423  hypothetical protein  85.86 
 
 
134 aa  173  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.419372  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  47.37 
 
 
746 aa  169  3e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.29 
 
 
713 aa  167  7e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  1.09484e-07 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  48.15 
 
 
278 aa  166  1e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  48.06 
 
 
813 aa  164  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  43.06 
 
 
275 aa  162  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0459  putative DNA replication primase  35.53 
 
 
644 aa  160  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  31.61 
 
 
443 aa  159  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2646  putative DNA replication primase protein  33.75 
 
 
620 aa  154  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3324  hypothetical protein  34.33 
 
 
615 aa  151  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  37.46 
 
 
778 aa  149  2e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4191  primase 2  34.06 
 
 
615 aa  148  4e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4842  hypothetical protein  34.06 
 
 
615 aa  147  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1765  putative DNA replication primase  35.69 
 
 
621 aa  147  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121744  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  40.08 
 
 
818 aa  145  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  42.28 
 
 
782 aa  144  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  48.24 
 
 
354 aa  144  8e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  48.24 
 
 
621 aa  144  1e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6494  Primase 2  36.34 
 
 
621 aa  139  3e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.921039 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  47.34 
 
 
1495 aa  137  9e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  43.69 
 
 
271 aa  137  1e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  38.16 
 
 
277 aa  137  1e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  46.75 
 
 
357 aa  135  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  37.13 
 
 
986 aa  134  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  41.75 
 
 
272 aa  133  1e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1624  primase 2  33.83 
 
 
309 aa  133  2e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  45.4 
 
 
1448 aa  127  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  44.79 
 
 
1448 aa  126  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  41.05 
 
 
1557 aa  124  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2011  hypothetical protein  76.25 
 
 
100 aa  124  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.133955  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  37.55 
 
 
1580 aa  124  1e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1991  hypothetical protein  81.94 
 
 
142 aa  119  2e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  40.61 
 
 
1389 aa  118  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  35.5 
 
 
338 aa  118  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0652  DNA primase TraC  81.94 
 
 
141 aa  116  2e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  39.13 
 
 
368 aa  114  7e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  37.35 
 
 
739 aa  114  7e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  30.96 
 
 
833 aa  114  9e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  37.05 
 
 
297 aa  112  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  44.68 
 
 
1077 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  38.77 
 
 
326 aa  106  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  33.69 
 
 
736 aa  106  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  37.01 
 
 
744 aa  105  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a034  DNA primase TraC  31.35 
 
 
411 aa  105  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000906567  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a039  DNA primase TraC  31.35 
 
 
357 aa  104  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.8393e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1504  hypothetical protein  37.33 
 
 
326 aa  103  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0017  cpp22  27.34 
 
 
408 aa  99  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113965  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  30.68 
 
 
383 aa  96.3  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  34.87 
 
 
1255 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6195  hypothetical protein  38.46 
 
 
523 aa  93.6  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374342  normal  0.646771 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0559  hypothetical protein  73.13 
 
 
248 aa  90.9  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.728059  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  26.45 
 
 
580 aa  84.3  1e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  33.91 
 
 
777 aa  80.1  2e-13  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.48 
 
 
970 aa  79.3  3e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  30.3 
 
 
775 aa  78.2  7e-13  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  29.01 
 
 
897 aa  78.2  7e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0611  Cpp22  26.51 
 
 
430 aa  78.2  8e-13  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  36.08 
 
 
777 aa  77.8  8e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  35.23 
 
 
777 aa  77.8  8e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  36.08 
 
 
777 aa  77.8  9e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.23 
 
 
970 aa  77  2e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>