296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2164 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  100 
 
 
279 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  100 
 
 
279 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  98.92 
 
 
279 aa  547  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  95.15 
 
 
268 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  91.42 
 
 
268 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  90.67 
 
 
268 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  88.81 
 
 
268 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  69.05 
 
 
313 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  65.32 
 
 
264 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4667  peptidase C26  64.92 
 
 
264 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2023  glutamine amidotransferase, class I  67.3 
 
 
266 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0637  glutamine amidotransferase  67.3 
 
 
266 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  64.96 
 
 
274 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0729  glutamine amidotransferase  68.48 
 
 
266 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30779  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  67.49 
 
 
262 aa  325  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  66.8 
 
 
261 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3012  peptidase C26  67.63 
 
 
261 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90022  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  64.88 
 
 
247 aa  318  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3040  peptidase C26  66.8 
 
 
279 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2379  peptidase C26  67.22 
 
 
261 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2993  peptidase C26  67.22 
 
 
261 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0655  glutamine amidotransferase, class I  72.22 
 
 
263 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1670  glutamine amidotransferase, class I  72.22 
 
 
264 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.661584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2929  glutamine amidotransferase, class I  72.22 
 
 
264 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2356  glutamine amidotransferase, class I  72.22 
 
 
264 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2789  glutamine amidotransferase, class I  72.22 
 
 
349 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2655  glutamine amidotransferase, class I  72.22 
 
 
263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2712  glutamine amidotransferase, class I  72.22 
 
 
264 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.840188  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1827  glutamine amidotransferase, class I  71.79 
 
 
263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  58.06 
 
 
253 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  57.66 
 
 
253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  57.26 
 
 
253 aa  284  9e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  58.17 
 
 
250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  57.37 
 
 
250 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  57.26 
 
 
253 aa  280  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  54.66 
 
 
254 aa  279  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  56.45 
 
 
253 aa  278  9e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0971  peptidase C26  56.5 
 
 
253 aa  276  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.174488  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1164  peptidase C26  55.65 
 
 
253 aa  274  9e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399023  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3194  peptidase C26  55.65 
 
 
253 aa  274  9e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0388042 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1197  peptidase C26  55.65 
 
 
253 aa  274  9e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0734619  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1106  peptidase C26  55.24 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  55.92 
 
 
254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0944  peptidase C26  55.06 
 
 
253 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1129  peptidase C26  55.06 
 
 
253 aa  272  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2645  glutamine amidotransferase  54.66 
 
 
254 aa  269  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1059  peptidase C26  54.25 
 
 
253 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22875  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48870  glutamine amidotransferase  56.28 
 
 
250 aa  265  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  56.15 
 
 
249 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3558  peptidase C26  52.63 
 
 
257 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2179  peptidase C26  52.23 
 
 
257 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5298  peptidase C26  53.28 
 
 
255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5207  peptidase C26  52.87 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5346  peptidase C26  53.69 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.176756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2121  peptidase C26  54.51 
 
 
253 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0384981  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1786  peptidase C26  52.23 
 
 
257 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  50.8 
 
 
255 aa  236  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1339  peptidase C26  50.79 
 
 
253 aa  231  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2706  glutamine amidotransferase  50.2 
 
 
249 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1298  peptidase C26  49.8 
 
 
297 aa  228  8e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.561811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4678  hypothetical protein  42.56 
 
 
255 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2902  glutamine amidotransferase, putative  50.97 
 
 
254 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00530511  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  49.6 
 
 
255 aa  222  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1740  peptidase C26  49.21 
 
 
256 aa  214  9e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  48.36 
 
 
253 aa  212  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  40.4 
 
 
267 aa  209  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  41.8 
 
 
269 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  47.24 
 
 
278 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  47.24 
 
 
278 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  41.41 
 
 
269 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1900  glutamine amidotransferase-like protein  49.18 
 
 
267 aa  205  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.720243  normal  0.134841 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5760  peptidase C26  47.72 
 
 
267 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  42.04 
 
 
269 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  41.02 
 
 
269 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6978  peptidase C26  46.94 
 
 
275 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  41.34 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  42.86 
 
 
259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2067  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  47.39 
 
 
253 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2865  peptidase C26  48.1 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136742  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2327  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  44.58 
 
 
254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1508  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  44.58 
 
 
254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1940  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  44.58 
 
 
250 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.343934 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1824  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  44.58 
 
 
250 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0824878 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2348  peptidase C26  44.18 
 
 
254 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1413  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  44.18 
 
 
254 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  49.59 
 
 
259 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  47.95 
 
 
259 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.272698 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01275  gamma-Glu-GABA hydrolase  43.78 
 
 
254 aa  194  9e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01286  hypothetical protein  43.78 
 
 
254 aa  194  9e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0244  glutamine amidotransferase  41.98 
 
 
281 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.682625  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  40.16 
 
 
267 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  48.33 
 
 
246 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1887  peptidase C26  41.56 
 
 
281 aa  191  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192004  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2762  peptidase C26  46.72 
 
 
251 aa  188  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126803  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1536  peptidase C26  41.39 
 
 
276 aa  188  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  45.56 
 
 
264 aa  185  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  44.44 
 
 
254 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1229  peptidase C26  38.78 
 
 
259 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.121618 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0710  peptidase C26  38.74 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.391948  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7781  peptidase C26  39.08 
 
 
274 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>