30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1947 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6132  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  289  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0428832  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1947  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  289  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00296399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1971  hypothetical protein  98.61 
 
 
144 aa  285  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0447204  normal  0.041626 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5258  hypothetical protein  85.42 
 
 
176 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000511759  normal  0.636992 
 
 
 
NC_010084  Bmul_1324  hypothetical protein  76.56 
 
 
145 aa  200  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587012  hitchhiker  0.00108007 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2516  hypothetical protein  66.67 
 
 
151 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22026  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2408  hypothetical protein  66.67 
 
 
151 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2366  hypothetical protein  66.67 
 
 
151 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456188  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1496  hypothetical protein  65.96 
 
 
151 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0639522  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3315  hypothetical protein  65.96 
 
 
151 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0170316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1993  hypothetical protein  65.96 
 
 
151 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648203  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2084  hypothetical protein  65.44 
 
 
191 aa  173  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304336  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3119  hypothetical protein  48.23 
 
 
165 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.822471  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3881  hypothetical protein  45.14 
 
 
140 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3298  hypothetical protein  48.89 
 
 
141 aa  107  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0765375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2173  hypothetical protein  41.67 
 
 
136 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136138  normal  0.0180917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4714  hypothetical protein  40.44 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1543  putative lipoprotein  35.77 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0500  hypothetical protein  42.57 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547819  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3151  putative secreted protein  34.38 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0749473  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1151  hypothetical protein  38.14 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2524  hypothetical protein  35.64 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0899957 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3489  putative lipoprotein  38.68 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4862  hypothetical protein  33.08 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3333  putative lipoprotein  36.79 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.919209  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3094  lipoprotein, putative  35.97 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173626  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04864  lipoprotein, putative  35.25 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0621  hypothetical protein  33.01 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0347929  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2344  putative lipoprotein  32.61 
 
 
153 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4270  hypothetical protein  31.25 
 
 
129 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>