More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1877 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1877  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 321 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6202  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 321 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1900  LysR family transcriptional regulator  99.67 
 
 		 303 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000669534 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1397  LysR family transcriptional regulator  98.02 
 
 		 303 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1814  LysR family transcriptional regulator  97.36 
 
 		 303 aa  587  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.841651  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1786  LysR family transcriptional regulator  97.03 
 
 		 303 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5177  LysR family transcriptional regulator  97.36 
 
 		 303 aa  583  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2174  LysR family transcriptional regulator  89.67 
 
 		 303 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.466728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2423  LysR family transcriptional regulator  89 
 
 		 303 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2298  LysR family transcriptional regulator  89 
 
 		 303 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2258  LysR family transcriptional regulator  89 
 
 		 303 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.206002  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1619  LysR family transcriptional regulator  87.71 
 
 		 303 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal  0.542444 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1783  transcriptional regulator, LysR family  88.33 
 
 		 304 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.294417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2459  LysR family transcriptional regulator  87.67 
 
 		 304 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157929  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3446  LysR family transcriptional regulator  71.76 
 
 		 331 aa  475  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3280  transcription regulator protein  71.33 
 
 		 303 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3286  LysR family transcriptional regulator  70.67 
 
 		 303 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3477  transcriptional regulator, LysR family  69.87 
 
 		 303 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3150  transcriptional regulator, LysR family  69.87 
 
 		 303 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1300  transcriptional regulator, LysR family  64.67 
 
 		 301 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43240  LysR family transcriptional regulator protein  63.88 
 
 		 302 aa  404  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2313  LysR family transcriptional regulator  63.88 
 
 		 301 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  50.64 
 
 		 327 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  50.64 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  50.64 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  50.84 
 
 		 300 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  51.17 
 
 		 300 aa  332  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  51.51 
 
 		 300 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  51.51 
 
 		 300 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  51.51 
 
 		 300 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  51.51 
 
 		 300 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  51.51 
 
 		 300 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  50.17 
 
 		 300 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 301 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 301 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 301 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 301 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 301 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 301 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 307 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1388  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 362 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0522975  normal  0.825805 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1300  transcriptional regulator, LysR family  50.17 
 
 		 309 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0123787  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4164  LysR family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1234  transcriptional regulator, LysR family  50.17 
 
 		 309 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.628194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1360  transcription regulator protein  50.5 
 
 		 309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.508448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0157  LysR family transcriptional regulator  48 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1953  LysR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 300 aa  301  7.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0409  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4493  LysR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.878724 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3697  LysR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 321 aa  297  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0666  LysR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 324 aa  295  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0457  transcriptional regulator, LysR family  46.13 
 
 		 314 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0328  transcriptional regulator, LysR family  45.93 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0339  LysR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.86 
 
 		 304 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  36.88 
 
 		 307 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  36.88 
 
 		 307 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1717  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1780  LysR family substrate binding transcriptional regulator  36.96 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  38.33 
 
 		 298 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5076  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  38 
 
 		 298 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 306 aa  218  8.999999999999998e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1493  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 313 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 305 aa  218  8.999999999999998e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1689  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 305 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0983  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  39.45 
 
 		 300 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1777  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2792  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.1 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1802  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0497764  normal  0.412734 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6302  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  39.67 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 289 aa  206  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2531  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6955  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373633  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 310 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3236  transcriptional regulator, LysR family  37.94 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875851  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  38.98 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0199  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 308 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1356  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 301 aa  202  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>