65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1723 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 366 aa  755    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  99.18 
 
 		 366 aa  751    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 366 aa  755    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  83.29 
 
 		 365 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  96.72 
 
 		 366 aa  713    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  92.08 
 
 		 366 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  92.35 
 
 		 366 aa  679    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  99.18 
 
 		 366 aa  751    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 366 aa  755    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  91.53 
 
 		 366 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  98.63 
 
 		 366 aa  749    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  92.08 
 
 		 366 aa  679    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  92.35 
 
 		 366 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  82.74 
 
 		 365 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  82.74 
 
 		 365 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  54.8 
 
 		 373 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  55.37 
 
 		 367 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  54.24 
 
 		 367 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  55.08 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  52.97 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  50.14 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  52.1 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  53.09 
 
 		 385 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  52.75 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  51.56 
 
 		 389 aa  350  3e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  50.43 
 
 		 367 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  51.84 
 
 		 389 aa  347  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  50.85 
 
 		 380 aa  347  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  51.9 
 
 		 397 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  49.29 
 
 		 376 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  46.35 
 
 		 376 aa  331  9e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  45.43 
 
 		 379 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  46.11 
 
 		 362 aa  325  5e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  46.11 
 
 		 362 aa  325  5e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  47.06 
 
 		 385 aa  323  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  39.94 
 
 		 354 aa  288  8e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  40.45 
 
 		 360 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  40.73 
 
 		 360 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  41.13 
 
 		 354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  32.61 
 
 		 385 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  30.49 
 
 		 413 aa  145  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  33.72 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  28.69 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  28.89 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  29.06 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  26.63 
 
 		 348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  27.84 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  25.56 
 
 		 369 aa  97.1  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  24.52 
 
 		 398 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  25.26 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  31.19 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  24.35 
 
 		 748 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  22.96 
 
 		 439 aa  46.6  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  33.59 
 
 		 287 aa  46.2  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  24.16 
 
 		 934 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  21.53 
 
 		 450 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.48 
 
 		 203 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 222 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  24.37 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 222 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1809  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  39.73 
 
 		 295 aa  43.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1256  oxidoreductase domain-containing protein  39.58 
 
 		 357 aa  43.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0576  prephenate dehydrogenase  39.73 
 
 		 253 aa  42.7  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00152184  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0591  prephenate dehydrogenase  39.73 
 
 		 253 aa  42.7  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.366481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>