19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1572 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1092  curculin-like (mannose-binding) lectin  100 
 
 		 270 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000112862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1572  curculin domain-containing protein  100 
 
 		 270 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1548  curculin domain-containing protein  100 
 
 		 270 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000088677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1091  curculin-like (mannose-binding) lectin  47.88 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000304641  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1571  curculin domain-containing protein  47.88 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00304753  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1547  curculin domain-containing protein  47.88 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000198605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4524  curculin domain-containing protein  37.91 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.465524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  37.55 
 
 		 374 aa  119  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  38.43 
 
 		 788 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  34.38 
 
 		 777 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  45.87 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4136  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  42.11 
 
 		 544 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2913  outer membrane protein  28.8 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110077  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2757  hypothetical protein  28.8 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4552  putative curculin-like lectin  27.27 
 
 		 852 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.602066  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2237  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  30.09 
 
 		 516 aa  55.8  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120186  hitchhiker  0.00817186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6642  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  31.9 
 
 		 173 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0494552 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0310  antifungal protein precursor, putative  31.47 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.375674  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1026  hypothetical protein  33.62 
 
 		 388 aa  42.7  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  decreased coverage  0.00589237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>