More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1543 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  68.92 
 
 
519 aa  665  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  89.94 
 
 
517 aa  912  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  97.1 
 
 
517 aa  996  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  90.91 
 
 
517 aa  926  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  89.94 
 
 
517 aa  912  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  99.42 
 
 
517 aa  1018  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  100 
 
 
517 aa  1023  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  96.13 
 
 
517 aa  981  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  89.94 
 
 
517 aa  912  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  96.71 
 
 
517 aa  991  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  96.52 
 
 
517 aa  989  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  100 
 
 
517 aa  1023  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  62.48 
 
 
510 aa  634  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  64.12 
 
 
518 aa  623  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  62.3 
 
 
507 aa  612  1e-174  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0843  ABC transporter related  66.2 
 
 
496 aa  606  1e-172  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.0750454 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  58.41 
 
 
506 aa  564  1e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  57.49 
 
 
517 aa  557  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  58.4 
 
 
507 aa  553  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  58.4 
 
 
507 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  57.96 
 
 
506 aa  550  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  58 
 
 
507 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  57.14 
 
 
506 aa  549  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  46.25 
 
 
501 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.25 
 
 
501 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  49.5 
 
 
495 aa  457  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  48.44 
 
 
519 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  46.22 
 
 
495 aa  446  1e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  45.71 
 
 
501 aa  445  1e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  49.6 
 
 
499 aa  446  1e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  45.71 
 
 
501 aa  443  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  45.71 
 
 
501 aa  445  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  45.71 
 
 
501 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  45.51 
 
 
501 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  45.71 
 
 
501 aa  445  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  45.31 
 
 
516 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  45.31 
 
 
516 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  45.19 
 
 
516 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  45.71 
 
 
501 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  45.71 
 
 
501 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  45.31 
 
 
516 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  44.95 
 
 
502 aa  441  1e-122  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  46.53 
 
 
495 aa  441  1e-122  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  45.31 
 
 
501 aa  442  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  44.97 
 
 
501 aa  441  1e-122  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  9.93507e-07 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  44.77 
 
 
503 aa  441  1e-122  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  44.51 
 
 
501 aa  438  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  45.67 
 
 
501 aa  438  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  44.77 
 
 
504 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  48.92 
 
 
509 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  46.15 
 
 
524 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  43.45 
 
 
501 aa  433  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 
527 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  46.57 
 
 
524 aa  435  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  46.51 
 
 
525 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  46.15 
 
 
524 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  45.11 
 
 
501 aa  433  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  43.59 
 
 
501 aa  434  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.49 
 
 
525 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  45.95 
 
 
524 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  45.95 
 
 
524 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  47.61 
 
 
498 aa  432  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  46.15 
 
 
524 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  47.5 
 
 
497 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  49.8 
 
 
497 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  45.82 
 
 
512 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  44.03 
 
 
501 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  42.91 
 
 
499 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  46.78 
 
 
508 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  43.98 
 
 
501 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  44.29 
 
 
501 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  45.29 
 
 
506 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  4.97905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  45.53 
 
 
516 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  44.07 
 
 
520 aa  422  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  43.92 
 
 
509 aa  423  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  45.32 
 
 
515 aa  425  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  45.04 
 
 
523 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  44.58 
 
 
513 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  43.74 
 
 
497 aa  424  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  43.89 
 
 
501 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  45.51 
 
 
494 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  46.11 
 
 
497 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  41.52 
 
 
501 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  44.31 
 
 
499 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  43.76 
 
 
501 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  43.31 
 
 
504 aa  420  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  44.31 
 
 
499 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  43.14 
 
 
496 aa  420  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
528 aa  419  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  44.58 
 
 
513 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  44.93 
 
 
500 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  47.9 
 
 
514 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  45.01 
 
 
504 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  45.36 
 
 
495 aa  419  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  47.23 
 
 
504 aa  419  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  45.11 
 
 
503 aa  417  1e-115  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  43.44 
 
 
507 aa  416  1e-115  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  43.03 
 
 
502 aa  417  1e-115  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  44.84 
 
 
505 aa  417  1e-115  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  46.52 
 
 
511 aa  418  1e-115  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>